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随着科研实验对样本通量增加、检测结果可靠性提升和操作时间减少等需求与日俱增,自动化技术在科研实验中的应用愈发关键。本次分享的实验研究,通过实践验证了在 Opentrons OT-2 自动化移液平台上执行 Avida Point-n-Seq® (PnS) 杂交靶向测序化学技术的自动化实验结果。该研究结果表明,OT-2 不仅在 NGS 样品预处理库的构建和靶标富集方面提升了处理效率,同时也保证了 NGS 的实验数据质量。这一研究成果有力证明了自动化技术在提升实验精度与效率方面的突出作用。
实验简介:
Avida Point-n-Seq 是一种全新的靶标富集化学技术。该技术是基于相互锁定的三维结构,专为协同间接捕获目标 DNA 靶标而设计。相较于传统的杂交捕获化学技术,这种高效的 DNA 捕获化学技术具有更高的特异性和更快的结合速度,在 1 小时内即可完成杂交靶向富集,这省去了许多如 PCR、纯化、定量等流程步骤,可以大幅节省时间并减少每个步骤的 DNA 损失。在这里,作者通过实践证实,Point-n-Seq 靶向测序 (TS) 样品制备工作流程可在 OT-2 移液平台上实现完全自动化。
在 OT-2 自动化移液平台上实现 Point-n-Seq 工作流程自动化,可以在保持检测结果稳定性和准确性的同时,大幅减少手动操作时间。该实验全程只需在 6 小时内就能制备出可用于测序的靶标富集库,其中手动操作时间仅占 10-15 分钟。

图:Avida Point-n-Seq & Opentrons OT-2 自动化移液平台
应用优势:
在 OT-2 移液平台上进行的 6 小时自动化 Avida Point-n-Seq 靶向测序样本前处理,只需 10-15 分钟的手动操作时间。
自动化执行 Point-n-Seq 测序工作流程与手动操作流程的测序效果相当。
Avida Point-n-Seq 500 (PnS 500) 检测试剂盒能准确检测 FFPE 和 cfDNA 样本中的肿瘤变异。它所需要耗费的检测时间更短同时检测一致性较高。

图 A: OT-2 移液平台上的 oint-n-Seg TS 工作流程

图 B:用于 NGS 样品制备和靶标富集的甲板配置
Point-n-Seq® 工作流程在 OT-2 自动化移液平台上的成功执行,为科研实验带来了效率与准确性的双重保障。如您需要深入了解这一案例背后更为详尽的应用策略与实践经验,请登陆 Opentrons 官网,点击“资源”进入“知识中心”,获取详细应用笔记。


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