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自动化 NGS 文库制备

NGS是一种强大的方法，但NGS工作流程的许多部分都很复杂，需要大量重复的移液操作，容易出错。实验室越来越倾向于使用自动化来帮助处理NGS工作流程。

如何评估是否引入自动化NGS

每个实验室都有自己的资源和目标。在评估自动化方案时，您需要结合您的实验室和样本的实际情况进行思考和评估。本指南将帮助您确定自动化NGS是否是您的正确决策。

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NGS工作站

在 OT-2 上自动化您的 NGS 工作流程

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OT-2可以自动化执行您的文库制备和测序前样本制备流程，与市面上多数试剂和磁珠广泛兼容。我们配备了一套NGS文库制备工作站，其中包括执行NGS文库制备的所有硬件模块和耗材。

  • 我们使用开源的Opentrons OT-2自动化移液平台处理了大部分 【OCTOPUS质粒测序】实验流程，并减少了70%的手动操作时间。

    – Bryan Jiang，Octant

  • 我们使用开源的Opentrons OT-2自动化移液平台处理了大部分 【OCTOPUS质粒测序】实验流程，并减少了70%的手动操作时间。

    – Bryan Jiang，Octant

  • 我们使用开源的Opentrons OT-2自动化移液平台处理了大部分 【OCTOPUS质粒测序】实验流程，并减少了70%的手动操作时间。

    – Bryan Jiang，Octant

研究热点

资源

试剂 应用数据 协议 确认 *
2S Turbo DNA Library Kit (rebranded as xGEN) Rapid High Quality Next Generation Sequencing Library Preparation With Swift 2S Turbo DNA Library Kits On The OT-2 Swift 2S Turbo DNA Library Kit Protocol: Fully Automated Swift 2S Turbo DNA Library Kit Protocol: Semi Automated

OPENTRONS

PARTNER
Omega Bio-tek Mag-Bind TotalPure NGS Fully automated NGS clean up and size selection with Omega Bio-Tek Mag-Bind TotalPure NGS on the OT-2 NGS Cleanup and Size Selection with Omega Bio-tek Mag-Bind TotalPure NGS

OPENTRONS

PARTNER
Illumina DNA Prep Kit Automated library preparation of small genomes using DNA preparation kits

OPENTRONS
Roche KAPA HyperPrep Kit Automated library preparation of small genomes using DNA preparation kits Roche HyperPrep

OPENTRONS
NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina Automated library preparation of small genomes using DNA preparation kits NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina

OPENTRONS

PARTNER
NEBNext Ultra II FS DNA Library Prep Kit for Illumina NEBNext Ultra II FS DNA Library Prep Kit for Illumina (4-part protocol)

COMMUNITY
NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (4-part protocol)

COMMUNITY
xGen DNA Library Prep MC & EZ Kits
IDT xGen MC protocol IDT xGen EZ protocol

OPENTRONS
Twist Library Preparation Kit Twist library prep (3-part protocol)

COMMUNITY
Nextera XT DNA Library Preparation Kit Illumina Nextera XT (4-part protocol)

COMMUNITY
AMPure XP NGS Library Cleanup with AMPure XP Beads

COMMUNITY
Illumina DNA Prep with Enrichment Kit Illumina DNA Prep with Enrichment (2-part protocol)

COMMUNITY
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Prep Zymo RiboFree Total RNA Library Prep (4-part, 2-robot protocol)

COMMUNITY
EZ DNA Methylation Gold Kits EZ DNA Methylation Gold (5-part protocol)

COMMUNITY
Oxford Nanopore Rapid Barcoding Kit Oxford Nanopore Ligation Sequencing Kit (2-part protocol)

COMMUNITY
seqWell plexWell LP 384 plexWell LP 384 (4-part protocol)

COMMUNITY
Lexogen QuantSeq 3′ mRNA-Seq Library Prep Kit FWD for Illumina Lexogen QuantSeq 3′ mRNA-Seq Library Prep Kit FWD for Illumina protocol

COMMUNITY
Ion Torrent Oncomine Focus Assay
Oncomine Focus Assay (4-part protocol)

COMMUNITY
Applied Biosystems AgriSeq HTS Library Kit AgriSeq HTS Library Kit (4-part protocol)

COMMUNITY
Swift Rapid RNA Library Kit (rebranded as xGEN) Swift Rapid RNA Library Kit (5-part protocol)

COMMUNITY
QIAGEN QIAseq Targeted RNAscan Panels QIAseq Targeted RNAscan Panels protocol

COMMUNITY
*验证类别：
  • Opentrons = 已由 Opentrons 团队验证，验证科学结果符合预期。
  • 合作伙伴 = 已由我们的试剂合作伙伴验证，验证科学结果符合预期。
  • 社区 = Opentrons 社区成员使用的协议。

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