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文章 · 2024年12月04日
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蛋白组学测序样本要求
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蛋白组学测序样本要求因实验目的、样本类型及后续分析需求的不同而有所差异。以下是一些通用的样本要求,但请注意,具体要求可能需要根据实验室的特定协议和所用技术进行调整:
一、样本质量
蛋白组学测序的样本类型广泛,包括但不限于细胞、组织、体液(如血液、尿液、脑脊液等)、微生物、动植物组织以及环境样本(如土壤、水、空气等)。
1、纯度与完整性:样本应尽可能纯净,避免杂质和污染物的干扰。对于组织样本,需要去除血管、脂肪、结缔组织等无关组织,确保样本的代表性。
2、新鲜度:新鲜采集的样本应尽快处理,以防止蛋白质降解和失活。对于无法立即处理的样本,应妥善保存,如液氮速冻后保存在-80℃冰箱中。
3、避免反复冻融:样本应避免反复冻融,以减少蛋白质的降解和变性。如需分装,应在液氮中速冻后分装,并尽快使用。
二、样本量
样本量因实验目的和样本类型而异。一般来说,以下是一些常见的样本量要求:
1、细胞:对于蛋白质组学项目,通常需要约1×107个细胞。
2、组织:动物组织样本通常需要鲜重约100mg(蛋白质组学项目)或500mg(磷酸化蛋白质组学项目)。植物组织样本则需要更多的鲜重,如200mg(蛋白质组学项目)或1g(磷酸化蛋白质组学项目)。
3、体液:如血液、尿液等,应根据实验需求采集足够量的样本,并注意避免溶血、污染等问题。
三、样本处理与保存
1、清洗与去除杂质:对于细胞和组织样本,需要使用预冷的PBS等缓冲液进行清洗,以去除培养基残留、血液和其他污染物。
2、裂解与提取:使用适当的裂解液和提取方法,将样本中的蛋白质释放出来。对于组织样本,可能还需要进行均质化、离心等步骤。
3、保存与运输:样本应保存在-80℃冰箱中,如需运输,则应使用干冰等低温运输方式。对于某些特殊样本,如胶条、蛋白溶液等,还需特别注意保存和运输条件。
四、其他注意事项
1、避免角蛋白污染:在处理样本时,应佩戴手套、口罩和头套等防护用品,避免角蛋白等污染物的污染。
2、样本标记与记录:对样本进行清晰的标记和记录,包括样本类型、采集时间、处理步骤等信息,以便后续分析和追踪。
3、遵循实验室规定:在样本处理过程中,应严格遵循实验室的规章制度和操作规程,确保实验的准确性和安全性。
蛋白组学测序样本要求涉及多个方面,包括样本类型、质量、量、处理与保存等。为了确保实验的准确性和可靠性,应严格按照实验室的规定和要求进行样本的采集、处理和保存工作。
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