高通量 NGS 实验自动化最佳实践:Opentrons Flex 应用

随着高通量测序(NGS)在科研、临床检测和转化医学中的深入应用,实验室面临的样本规模和操作复杂度持续上升。传统人工操作模式逐渐成为效率与质量的瓶颈。如何稳定、高效地完成大批量 NGS 实验,成为许多实验室关注的重点。Opentrons Flex 作为新一代自动化平台,正在被广泛用于高通量 NGS 实验中。本文将围绕实际应用,总结 Opentrons Flex 在 NGS 自动化中的最佳实践。

高通量 NGS 实验自动化最佳实践:Opentrons Flex 应用

移液工作站

为什么高通量 NGS 实验必须走向自动化?

高通量 NGS 实验往往涉及几十甚至上百个样本,并且流程步骤多、重复性强。人工操作不仅耗时,还容易因疲劳或操作差异引入误差,影响文库质量和数据一致性。

通过自动化系统,实验流程可以被标准化执行,从而显著提高重复性和稳定性。这也是越来越多实验室将 NGS 自动化作为长期发展方向的重要原因。

Opentrons Flex 在高通量 NGS 中的核心优势

Opentrons Flex 专为复杂实验流程设计,具备高精度移液能力和良好的流程可扩展性。在高通量 NGS 场景下,其优势尤为明显。

Flex 支持多种规格耗材和主流建库试剂,能够灵活适配不同实验方案。同时,其模块化结构便于整合磁力、温控等功能模块,满足多样化的实验需求。

最佳实践一:从样本前处理开始实现自动化

在高通量 NGS 实验中,样本前处理是最适合优先自动化的环节。通过 Opentrons Flex,可完成样本分装、稀释、混匀等操作,确保每个样本在相同条件下处理。

这一阶段的自动化不仅可以减少人为误差,还能为后续文库构建提供更加稳定的起点,有助于整体流程质量控制。

最佳实践二:文库构建流程的标准化执行

文库构建是 NGS 实验中最关键、也是最容易出现批次差异的步骤。Opentrons Flex 可自动完成加酶、反应体系配置、磁珠纯化和洗脱等操作。

通过预设程序执行建库流程,可以有效减少不同批次、不同操作者之间的差异,使文库质量更加一致,尤其适合高通量运行场景。

最佳实践三:合理配置模块与实验节奏

在高通量应用中,合理配置模块是提升效率的重要策略。Flex 可搭配磁力模块、温控模块等,实现流程连续运行,减少人工干预。

同时,实验室应根据样本数量合理规划批次节奏,避免一次性超负荷运行,从而在效率与稳定性之间取得平衡。

最佳实践四:数据与流程的持续优化

自动化并不意味着流程一成不变。使用 Opentrons Flex 后,实验室可以根据实际运行数据不断优化移液参数和流程细节。

通过对失败案例和异常数据的回溯分析,逐步调整程序设置,有助于进一步提升高通量 NGS 实验的成功率和可重复性。

总结:Opentrons Flex 是高通量 NGS 自动化的重要实践工具

综合来看,Opentrons Flex 为高通量 NGS 实验提供了稳定、灵活且可持续优化的自动化解决方案。通过从样本前处理到文库构建的系统化自动化实践,实验室不仅能够显著提升效率,还能在长期运行中保持数据质量的一致性。

对于希望实现高通量、标准化和规模化 NGS 实验的实验室而言,Opentrons Flex 正在成为值得借鉴和落地的自动化实践平台。

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