比利时生命科学实验室VIB使用OT-2进行自动化NGS文库制备

Stephane Plaisance, VIB的分子生物学家，倡导引入自动化技术来改进实验室用于长读长和短读长测序的NGS文库制备工作流程。

随着测序服务的需求量增长，实验室需要寻找能够大幅度提升工作产能的方法，实验室自动化就是简化和扩展测序操作的有效措施。比利时领先的生命科学研究所之一VIB Nucleomics的分子生物学家Stephane Plaisance选择Opentrons自动化移液平台，用于提升实验室的 NGS 文库制备工作效率。

复杂而乏味的实验室工作限制了实验室效率

VIB Nucleomics 是一个以测序为核心业务的研究所，致力于为 VIB 研究人员以及研究各种生命科学学科的外部学术和工业研究人员提供服务。

VIB 的 NGS 分析专家Stephane Plaisance与其他九名实验室科学家一起共同完成实验工作，包括 NGS 文库制备、在不同平台上进行长读长和短读长测序以及全基因组表达分析。几年前，他的团队面临了实验产出效率低的问题。冗长乏味的移液操作限制了他们的工作效率，并给他们的实验室技术人员带来了工作压力。他们想用自动化来改善工作流程，但当时许多大型 NGS 机器人不具备能够适配实验室项目多样性的能力。

“ 我们开始关注大型、更昂贵的机器人，但这些机器人更适合高吞吐量的日常工作，而我们需要根据我们承担的每个项目调整我们的流程。这是我们最终选择Opentrons的原因，它具备较高的灵活性和性价比。”

–Stephane Plaisance

VIB将实验室自动化集成到测序核心工作流程中

在进行了全面的市场分析后，评估了产品性价比和使用灵活性，Stephane选择了 Opentrons OT-2 自动化移液机器人，OT-2受到实验室工作人员的一致好评。根据实验室的特定应用需求，他们逐渐调整出了最适合该实验室的实验流程协议。在他们购买了第一台OT-2后不到两年，VIB Nucleomics 又购买了四台，现在有五台 OT-2 自动化移液机器人协助他们完成不同的实验室任务。其中三台用于 Illumina NGS 文库制备，负责自动化PCR前处理和后处理工作。

“ 对于 Illumina DNA 文库准备，我们在专用的 PCR 前处理实验室中对一台OT-2进行初始样本操作，然后我们将孔板从那个房间中取出进行 PCR，然后我们使用第二台OT-2进行PCR后处理工作。”

–Stephane Plaisance

一台OT-2用于研发，最后一台OT-2用于在文库制备完成后对样本进行重新混合。OT-2的灵活性和Opentrons团队提供的产品支持，再加上Plaisance和VIB团队的创造力，使得对该设施投资推动实验室自动化取得了巨大成功。与此同时，一个包含1万个样本的宏基因组项目已经成功使用OT-2流水线执行，更多的大型项目即将到来！

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