Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能

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HIT挑选 [樱桃挑选]

HIT挑选,通常称为樱桃挑选,是从大量样本中精确选择显示出所需特征的特定样本或‘HIT’的过程。这在药物发现、高通量筛选、基因组研究和蛋白质组学等工作流程中至关重要。

HIT挑选和樱桃挑选本质上指的是相同的过程。两个术语都描述了基于所需特征从较大样本集中选择和分离特定样本或‘HIT’的过程。这一过程在药物发现、基因组研究和蛋白质组学等高通量工作流程中至关重要。

HIT挑选的规模带来了挑战,特别是在手动操作时,可能会出现人为错误、体力疲劳和处理速度慢的问题。为了减轻这些问题,建议自动化HIT挑选。自动化系统结合了机器人技术和液体处理设备,可以快速而准确地选择‘HIT’,通常还包括条形码识别、温控和数据管理软件等功能。

HIT 挑选 Vs. 樱桃挑选

术语‘HIT挑选’起源于从大规模筛选过程中选择‘HIT’或阳性结果的实践,通常是在识别潜在药物候选者的背景下使用。‘HIT’这个术语具有隐喻意义,用以表示一个积极的结果,就像在靶向游戏中命中目标一样。

另一方面,‘樱桃挑选’这个术语从最初的背景(从树上挑选最成熟或最理想的樱桃)迁移过来。在科学研究中,樱桃挑选指的是从较大的样本集中仔细选择最有前景或最合适的样本进行进一步分析的实践。

需要 HIT 挑选的工作流程HIT 挑选在以下工作流程中尤为重要:1.  药物发现:在高通量筛选过程中用于识别显示出对感兴趣靶标具有活性的有前景的化合物。2.  基因组研究:特别是在克隆文库构建和筛选中,需要分离显示出期望表型或基因型的特定克隆。3.  蛋白质组学:用于识别与目标分子相互作用或展示期望功能的‘HIT’蛋白质。

Cherrypicking从未如此简单

OT-2 是一款台面式液体工作站,设计方便灵活,可自动处理许多常见应用。

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HIT挑选的最佳方法1.  手动移液:这种方法涉及使用移液器手动处理每个样本。尽管这种方法精度高,但劳动强度大且耗时。2.  机器臂系统:这些系统可以自动化移液过程,提高通量并减少人为错误。3.  声学分配:这是一种非接触的方法,通过声波转移少量液体。它具有高度的精确性,并能处理大规模样本库。

协议亮点

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为何 HIT 挑选如此困难?

樱桃挑选因任务规模庞大而具有挑战性。在高通量工作流程中,可能需要筛选成千上万甚至数百万个样本。手动选择和处理‘HIT’可能非常繁琐、耗时,并且容易出错。

手动移液的HIT挑选主要面临以下挑战:

  1. 通量:手动移液无法匹配自动化系统的速度,因而不适合大规模项目。
  2. 错误:手动移液容易出现人为错误,如移液不准确、交叉污染或样本识别错误。
  3. 疲劳:重复的移液操作可能导致身体疲劳,从而进一步增加错误的风险。

如何实现 HIT 挑选流程的自动化

HIT挑选(樱桃挑选)的自动化通常涉及将机器人系统与液体处理设备集成。这些系统可以根据预设标准快速且准确地挑选‘HIT’。它们通常包括样本追踪的条形码功能、用于样本稳定性的温控功能,以及用于数据管理和分析的软件。

与手动相比,自动化处理HIT挑选的优势

  1. 提高通量:自动化系统可以在显著更短的时间内处理更大的样本量。
  2. 减少错误:自动化最小化了人为错误,确保结果更加准确和可靠。
  3. 重复性:自动化系统提供一致的操作性能,确保不同运行和操作人员之间的结果更具可重复性。
  4. 成本效益:尽管初期投资可能较高,但自动化系统通过降低劳动成本和提高效率,从长远来看可以更具成本效益。

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