Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能

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分析样本制备

这是一个关键过程,将样本转化为适合分析程序(如PCR、NGS和细胞实验)的格式。

分析样本准备可能包括提取/纯化、浓缩/稀释或修改,这取决于分析的要求。尽管其重要性不言而喻,但它带来了诸多挑战,如保持重复性、避免污染以及管理劳动密集型工作流程——尤其是手动操作时。自动化系统可以解决这些问题,提供更高的准确性、增强的重复性、节省时间和劳动,并降低污染风险。

手动标准化、使用液体处理系统的标准化和使用微孔板读数器的标准化是执行这一过程的一些方法。然而,自动化系统因其更高的准确性、重复性和效率以及降低的污染风险而越来越受到青睐。



分析样本制备的工作流程

分析样本制备是分子生物学和蛋白质组学等许多工作流程的基础:

  1. PCR和qPCR:在这些过程中,样本准备包括DNA或RNA的提取和纯化。
  2. 下一代测序(NGS):在NGS工作流程中,样本准备涉及步骤如DNA片段化、接头连接和扩增。
  3. 蛋白质分析:对于像ELISA或Western blot这样的蛋白质分析,样本准备可能包括蛋白质提取、定量和可能的变性处理。
  4. 细胞实验:在这些实验中,样本准备可能包括培养细胞、用特定化合物处理细胞,然后可能需要裂解细胞以释放其内容物。

分析样本制备从未如此简单

OT-2 是一款台面式液体工作站,设计方便灵活,可自动处理许多常见应用。

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分析样本制备的最佳方法

  1. 提取/纯化:这可能涉及像苯酚-氯仿提取这样的DNA或RNA提取过程,或用于蛋白质纯化的各种色谱技术。
  2. 浓缩/稀释:样本可能需要使用离心过滤器等方法进行浓缩,或稀释至适合分析的浓度。
  3. 修改:一些分析需要在分析前对样本进行化学或酶学修改。例如,蛋白质可能需要在运行SDS-PAGE之前进行变性和还原。

协议亮点

Opentrons 可帮助您使用 OT-2和 Opentrons Flex 的开源协议自动进行分析样本制备

为什么分析样本制备如此闲难?

分析样本制备通常被认为是实验过程最具挑战性的部分。它需要高度的精确性和准确性,以确保结果的重复性。在这个阶段,样本最容易受到污染或降解,这可能导致结果不准确。此外,最佳的样本准备协议可能会因样本类型和特定分析的不同而有很大差异。

使用手动移液进行分析样本制备的关键挑战

  1. 重复性:即使是移液技术中的微小变化也可能导致结果的显著差异。
  2. 污染:在准备过程中,样本容易受到污染,特别是在手动移液时。
  3. 时间和劳动密集型:手动准备样本进行分析可能非常耗时且劳动密集,尤其是当处理大量样本时。

分析样本的自动化制备

分析样本制备的自动化可以通过机器人液体处理系统实现。这些系统可以准确地分配精确体积,混合试剂,甚至执行加热或冷却等操作。使用这些系统可以减少人为错误,提高重复性,并显著加快样本准备过程。

与手动相比,自动化制备分析样本的优势

  1. 提高重复性:自动化系统确保样本处理条件的一致性,从而提高实验之间的重复性。
  2. 节省时间和劳动:自动化系统能够同时处理多个样本,显著减少所需的时间和劳动。
  3. 降低污染风险:自动化系统减少了人工处理的数量,从而降低了污染的风险。

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欢迎联系我们,我们的专业应用科学家团队将帮助您确认自动化实验流程是否与您的需求适配。如果您有查看实验流程运行的需求,可与我们预约线上Demo,与专家团队深入讨论您的实验需求。

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