如何通过 Opentrons Protocol Library 运行 NGS 流程？

随着二代测序（NGS）在科研与临床检测中的广泛应用，实验室对自动化、标准化流程的需求不断提升。Opentrons 自动化平台因其开放性和高性价比，成为许多实验室搭建 NGS 自动化流程的重要工具。其中，Opentrons Protocol Library 为用户提供了现成、可复用的协议资源，大幅降低了自动化上手门槛。那么，实验室该如何借助 Opentrons Protocol Library 高效运行 NGS 流程？

移液工作站

Opentrons Protocol Library 的核心作用

Opentrons Protocol Library 是一个集中管理自动化协议的资源库，涵盖核酸提取、文库构建、磁珠纯化、PCR 配置等多个常见 NGS 实验步骤。通过这些协议，实验人员无需从零编写代码，也能快速将手工流程迁移到自动化平台上。

对于 NGS 实验而言，流程往往步骤多、重复性高，对移液精度和一致性要求严格。Protocol Library 的存在，使实验室能够基于成熟流程快速部署自动化方案，减少人为操作差异。

NGS 流程中适合自动化的关键环节

在典型的 NGS 工作流程中，多个步骤都非常适合通过 Opentrons 实现自动化运行。例如样本前处理阶段的试剂分装、磁珠清洗、洗脱，以及文库构建过程中的多次移液和混匀操作。这些步骤重复性高、耗时长，是人工操作中最容易产生误差的环节。

通过 Protocol Library 中的现成协议，用户可以将这些步骤整合为连续运行流程，使样本在同一平台上完成多个实验阶段，提高整体效率。

使用 Protocol Library 运行 NGS 流程的基本思路

实验人员在使用 Opentrons Protocol Library 时，通常会根据自身 NGS 实验类型选择对应协议，例如 DNA 文库构建或 RNA 文库构建流程。下载或导入协议后，可以在 Opentrons 软件中对样本数量、试剂体积、耗材类型进行参数化设置，以适配具体实验需求。

在运行前，对 deck 布局和耗材摆放进行确认尤为关键。合理的板位和枪头配置，不仅有助于流程顺利执行，也能减少运行中断风险。

协议标准化与实验重复性的提升

NGS 实验对重复性要求极高，尤其是在大批量样本处理时。通过 Opentrons Protocol Library 运行流程，可以将每一次实验的移液路径、时间顺序和体积控制在同一标准之下，有效降低批次间差异。

这种标准化优势在多人员操作或多项目并行的实验室中尤为明显，有助于建立稳定、可追溯的 NGS 实验体系。

灵活调整与二次优化的可能性

虽然 Protocol Library 提供的是通用协议，但并不意味着流程不可调整。具备一定自动化经验的用户，可以在现有协议基础上进行二次修改，例如调整混匀方式、延长孵育时间，或整合多个协议形成完整的端到端 NGS 自动化流程。

这种“先用再改”的模式，使实验室能够在不影响日常实验的前提下，逐步深化自动化应用。

实验室实施中的注意事项

在实际运行 NGS 流程时，仍需关注试剂兼容性和耗材匹配问题。不同磁珠体系、试剂盒品牌在液体粘度和操作顺序上可能存在差异，使用 Protocol Library 协议前，建议进行小规模验证。

同时，定期维护移液模块和校准系统，也是保证长期运行稳定性的关键。

结语

通过 Opentrons Protocol Library 运行 NGS 流程，为实验室提供了一条低门槛、高可复制性的自动化路径。它不仅提升了实验效率和数据一致性，也为实验室未来扩展高通量测序能力打下基础。随着自动化协议不断丰富，基于 Opentrons 的 NGS 工作流程正成为越来越多实验室的现实选择。

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