Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站兼容哪些试剂体系?

在高通量测序(Next-Generation Sequencing, NGS)实验中,从文库制备到纯化、扩增等多个步骤涉及多种试剂体系,不同试剂的品牌、协议和反应条件对自动化平台的兼容性至关重要。Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站凭借其开放、模块化的设计,能够兼容多种主流 NGS 试剂体系,使得科研实验室可以灵活构建自动化流程,从而提升工作效率、减少误差并节省人工操作时间。本文将详细介绍该平台兼容的主要试剂体系、背后的支持策略及兼容优势。

 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站兼容哪些试剂体系?

移液工作站

什么是 Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站?

Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站是一款专为大规模、全自动化 NGS 文库制备设计的液体处理平台。它采用模块化架构,配备 96 通道移液器、热循环模块、磁珠模块等功能组件,能够自动执行包括转座反应、连接、条形码标记、加 A 尾、PCR 扩增、磁珠纯化、片段筛选等文库构建流程。用户可以根据实验需求灵活组合不同模块与试剂体系。

兼容的 NGS 试剂体系

1. 主流文库构建试剂体系

Opentrons Flex 工作站支持市场上大多数主流 NGS 文库制备试剂盒,这些试剂体系广泛应用于全基因组、目标区域测序等多个应用场景,包括基于酶切片段化、转座酶片段化或机械剪切等不同建库策略。Opentrons 的开放系统设计允许用户选择适合的试剂品牌,并通过标准协议实现自动化操作。

例如,QIAseq FX DNA Library Kit 和 QIAseq Library Normalizer Kit 都已被验证可直接用于 Opentrons Flex 平台,成功实现高质量文库的构建和归一化。

2. 片段化与标记试剂体系

在 NGS 文库制备过程中,片段化与标记(tagmentation)是核心步骤之一。Opentrons Flex 能够兼容通过转座酶或其他酶体系实现片段化的试剂体系,这样用户可以选择市场上常见的 DNA 片段化和标记试剂盒,确保文库构建的高效和稳定。

该平台的兼容性得益于其精确的液体处理能力和灵活的协议自定义功能,用户能够根据不同试剂体系的要求调整操作参数,实现无缝对接。

3. 磁珠纯化与洗脱试剂体系

无论是爪形磁珠还是涂层磁珠纯化体系,Opentrons Flex 都能通过模块化的磁力架模块完成自动磁珠捕获、洗涤、干燥和洗脱等操作。这些试剂常用于去除杂质,如酶、缓冲盐等,提高文库的质量,确保后续高通量测序的准确性。

此外,Opentrons Flex 还能够支持 96 孔深孔板的磁珠纯化操作,在磁珠捕获后,平台可自动处理洗涤、干燥等步骤,减少了手动操作并提高了处理效率。

4. 扩增与归一化试剂体系

在 PCR 扩增和文库归一化阶段,Opentrons Flex 工作站能够兼容多种扩增试剂和文库归一化试剂体系。通过配备的温控模块、热循环模块等,用户可以执行不同品牌试剂的 PCR 循环反应和归一化操作,例如 QIAseq Normalizer Kit,可以帮助完成文库归一化操作。

此外,平台支持多种扩增协议,可以根据实验需求自定义扩增条件,确保文库质量的稳定性。

为什么 Opentrons Flex 在试剂兼容性上具有优势?

开放式架构

与一些只支持专有试剂的自动化平台不同,Opentrons Flex 提供了一个开放系统设计,允许用户根据实验需求选择不同品牌的试剂体系。通过 Opentrons 提供的 Protocol Library,用户可以获取与不同试剂体系兼容的标准化脚本,并可根据反应体系调整参数,从而满足不同试剂的反应条件。

模块化硬件支持

Opentrons Flex 工作站支持多种功能模块组合,包括温控模块、磁力模块和热循环模块等。这种模块化设计使得不同的实验步骤和试剂体系可以在同一平台上无缝对接,完成文库制备的全流程,从而提高自动化程度和实验效率。

丰富的验证协议与资源

Opentrons 提供了大量验证协议和 Protocol Library,帮助用户快速开始工作站的使用。对于不同试剂体系,Opentrons 已经过验证的协议可以减少开发新的自定义协议的门槛,保证实验可重复性和高效性。

如何在 Flex 上运行不同试剂体系?

选择合适的试剂体系:根据实验需求选择文库构建试剂,如 QIAseq 系列或其他品牌的试剂。

下载或调整协议:从 Opentrons Protocol Library 获取标准化的自动化脚本,或根据实际需求调整反应体系。

模块配置:根据文库构建流程,如片段化、接头连接、磁珠纯化等步骤,灵活组合所需模块,确保兼容不同试剂。

执行与优化:运行自动化流程,并根据反馈调整反应条件或模块配置,确保实验的顺利进行。

结语

Opentrons Flex 高通量 NGS 工作站以其开放架构和模块化设计,支持市场上大多数主流 NGS 试剂体系的兼容。无论是文库构建、片段化、磁珠纯化还是 PCR 扩增等流程,平台都能够高效完成,帮助科研人员大幅提高自动化水平,减少人工操作误差,提高实验的可重复性和准确性。凭借其灵活的配置和强大的兼容性,Opentrons Flex 工作站成为生命科学领域实验室实现高通量测序自动化的理想选择。

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