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2020 年 04 月 24 日

客户案例 | Zymo Research 使用OT-2进行新冠病毒检测

Zymo Research为从事新冠病毒检测的研究人员提供生物医学工具和服务,包括为Opentrons客户提供支持。

Zymo Research 是一家为研究人员提供生物医学工具和服务的企业。目前,他们正在帮助各大实验室进行新冠病毒检测。为此他们创建了一个从样本收集、RNA 提取到基于rRT-PCR检测的完整的新冠病毒检测工作流程,该工作流程已经进入FDA的紧急使用授权前审查状态中。Zymo Research 作为 Opentrons 的联合开发测试系统合作伙伴,Zymo Research 愿意为任何有兴趣将该工作流程加载到 Opentrons 液体处理机器人上的组织提供技术支持。

今天我们邀请到 Zymo 的研究专家 Casey Cruz 为大家分享他们如何使用 OT-2 进行新冠检测,协助抗击全球疫情。

Opentrons: 疫情爆发前,您的日常生活是怎样的?

Casey Cruz: 在疫情爆发前,我们最初购买 OT-2 是为了做 RNA-Seq 文库制备的,后期假如我们的工作不再需要用于新冠检测,我们仍然非常期待与 Opentrons 合作开展这个项目。为此,我们甚至编写了一个用于 rRT-PCR 设置的脚本,并希望将其应用于 Pangea 实验室的 SARA-CoV-2 实验室开发的测试(LDT)。作为 RiboFree RNA-Seq试剂盒的产品经理,我被OT-2的价格和 Opentrons 的开源社区所吸引。在项目初步验证期它的各方面表现都很棒,但由于疫情爆发,我不得不暂时改变研究方向,转而投入到协助新冠病毒检测项目中。

Opentrons: 您现在所做的工作与您的日常工作内容有什么不同吗?

Casey: 我们现在的工作是提交关于新冠病毒检测工作流程的 FDA 紧急使用授权申请。这个项目工作流程包含从样本采集到 RNA 提取再到 rRT-PCR 检测,从运输介质 DNA/RNA 保护剂开始,在样本收集和运输过程中需要把新冠病毒完全灭活,这样就可以保证 RNA 在室温下能够最高保存30天。这是在实际应用中一个很好的方法,使生物样本中的 DNA/RNA 可以在没有冷链的情况下保存,当样本被运回实验室就可以用于自动化样本处理工作流程。

接下来,我们使用 Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 试剂盒进行 RNA 提取,并使用 Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR Test Kit 试剂盒完成新冠病毒检测的工作流程。

使用 Quick-DNA/RNA Viral MagBead 试剂盒的 Zymo Research 数据。图片来源: Zymo Research

Pangea 实验室是一家获得 CLIA 认证和 CAP 认证的临床测试实验室,这里的 SARA-CoV-2 实验室开发测试 (LDT) 是从收到样本开始,然后他们使用 KingFisher 提取 RNA,使用 Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR 试剂盒检测新冠病毒。该工作流程使用的试剂是 Zymo Research 目前正在等待美国食药监局(FDA)紧急使用授权(EUA)的试剂。让这个系统启动并运行,并为申请紧急使用授权(EUA)进行验证实验,是 Pangea 团队目前正在做的主要工作。

Opentrons: 新冠病毒检测项目中,最让您感到兴奋的是什么?

Casey: 最让我兴奋的是,这个项目在这个关键时刻正在帮助有需要的人们。很多时候,当你做研究时,你会感觉与结果相去甚远,但这次不同。通过这个新冠检测工作流程,我能明显地感受到我们的技术正在帮助医疗专业人员并帮助阻止疾病的传播,这将关系到很多人的生命健康。我很感激能够为此做出贡献,这对世界将产生持久的影响并真正发挥作用。

Opentrons: 关于这个项目,您认为关键要点是什么?

Casey: 我认为关键在于确保安全运输临床样本。DNA/RNA 保护剂可确保病毒灭活,从而保证进行诊断测试的人员安全;检测人员需要做的就是对试管外部进行去污处理,确保样本就可以安全使用。我们非常重视确保从样本采集开始的诊断全过程安全性和准确性。

如果您想在自己的实验室中部署同款 Opentrons 系统,请联系 covid-19@opentrons.com。

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