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2020 年 12 月 22 日

客户访谈 | Fidabio 产品软件与 OT-2 Python API 集成案例

Fidabio 使用 OT-2 和 Opentrons Python Protocol API 创建了分析蛋白质相互作用的设备,用于生物药物开发。

Fidabio是一家由哥本哈根大学的研究人员创立的生物技术公司,坐落于丹麦,核心业务是帮助科研工作者推进复杂的生物学项目,例如多重结合蛋白、脂质体、外泌体和双特异性研究项目。Fidabio发明的FIDA技术可在天然条件下对蛋白质和纳米颗粒进行简单、准确和快速的检测和表征。

今天我们采访的是 Fidabio 的 CEO Brian Sørensen 和 CSO Henrik Jensen。为了创建一台用于分析生物药物开发过程中的蛋白质间相互作用的设备。他们使用了 Opentrons OT-2 自动化移液机器人Opentrons Python API 以及他们自己的软件集成创建了用于样品制备的复杂稀释工作流程。Brian Sørensen 和 Henrik Jensen 会给大家分享他们的 OT-2 的使用体验。

Opentrons: 请您介绍一下您的研究背景

Brian Sørensen: 我们一直在哥本哈根大学工作,直到去年年底。

Henrik Jensen: 在大学里,我们使用OT-2自动化移液平台进行样品制备工作流程中的梯度稀释工作。我认为 OT-2 自动化带来的便利性能够有助于在实验室内进行整体集成。

Opentrons: 您的研究项目是什么样的?

Brian Sørensen: 我们的内部试点通常是小型实验,手动移液也是可以满足的。但是,当我们的客户需要进行大型实验时,让技术人员仅靠提升手动移液速度来实现是不可行的。机器人可以代替人工移液,科研人员可以把这些时间节省下来用来做实验分析。一旦实验涉及更大的稀释系列,或需要分装更多样品时,就需要用到自动化。我举一个例子,我有一个客户分析了附近医院的数千个患者样本,这么大批量的操作是需要通过自动化来实现的。

Opentrons: 您为什么选择 OT-2?

Brian Sørensen: 我们购买了独立的液体处理机器人,但很快就发现我们可以将其与我们自己的软件集成。

Henrik Jensen: 自动化的优势我认为有以下几点:第一,可以帮助我们处理大量的样本。第二,在实验室工作中,准确性也很重要。如果您能以标准化的方式进行工作,则自动化有利于改善结果。

Brian Sørensen: 可重复性是关键,您在实验室中人为因素越高,则可重复性就越低。

Henrik Jensen: 第三,如果您可以使用机器人,在整个工作流程中我们对操作员在知识和技能层面的要求将变得更小。

Brian Sørensen: 如果您只是做一些常规分析,那么您可以手动完成所有工作。但这可能不是进行整个检测的最佳方式,且不能更好地发挥技术人员的最大价值。

Henrik Jensen: 使用自动化移液平台,您可以更轻松地记录您的研究,因为您可以共享移液脚本,研究人员可以重现数据。自动化能够详细呈现您的下一步操作以及历史操作。

Brian Sørensen: 如果您想将您的实验从实验室转移到另一个实验室,并且实验中有手动步骤 —

Henrik Jensen: —自动化要容易得多。这一因素也是我们将制备环节甚至整个工作流程都变成自动化的根本原因之一。

Brian Sørensen: 最初集成OT-2时,我们认为它是一个不错的小众应用。但是,当我们看到更多客户也有兴趣将 OT-2 作为其 Fidabio 工作流程的一部分。我们可以在软件中看到无缝集成更多实验室的可能性。于是我们就把Fidabio的软件和Opentrons连接在一起。

Opentrons 集成到 Fidabio 的软件平台上。 图片来源:Fidabio

Opentrons: 您的OT-2的实际使用体验怎么样?

Henrik Jensen: 从硬件的角度来看,它即插即用,非常方便。不过在协议方面仍然有一些需要我们学习的地方,但其实这也不难。我们的软件工程师 Morten 自己编写了脚本。脚本的创建实际上非常简单。

Brian Sørensen: OT-2 可以无缝融入我们的工作流程。它简化了生成结合曲线的工作。我们把大量重复移液的工作交给机器人完成而不是占用技术人员的时间,节省了人力成本和时间成本。同时 OT-2 这非常适合我们的系统以及其他自动化实验室系统。它是一个端到端的自动化工作流程。

Henrik Jensen: 我们之前没有这方面的经验。但是,由于我们自己也是仪器开发人员,我们已经对这个过程已经有了很好的理解。

Opentrons: 在购买OT-2之前,您使用过其他实验室自动化设备吗?您对实验室自动化的过程有什么期望?

Brian Sørensen: 当我们开发自己的平台时,高度自动化对我们来说很重要。从这个意义上说,OT-2 很好地增强了我们自己的一个关键卖点。它与我们自己平台中的关键元素之一非常吻合。

Opentrons: 您使用 OT-2 的具体用途是什么,它如何融入您的工作流程?

Brian Sørensen: 对我们来说,我们销售的仪器必须非常精确。我们知道我们的技术有能力提供非常准确的数据,但在生物学界,即使是很小的变化也会影响结果。尤其是我们使用的应用程序(例如药物研发),我们必须确保我们尽可能多地控制实验。为保障更好的实验产出严格控制准备过程。

Henrik Jensen: 在我们整合之前,我们有一个分析开发合作伙伴,它允许我们将信息输入系统,系统会计算出您需要什么来制作解决方案。以前我们是手动进行的。但接下来我们会用OT-2制作脚本,而不是手动进行。

Opentrons: 您是否有其他自动化项目的计划?

Brian Sørensen: 我们一直在寻找进一步的发展。虽然我们公司还年轻,但我们正在快速发展期,未来可能会尝试更多的整合和开发项目。

Opentrons: 关于使用 OT-2,您还有其他想要分享的吗?

Henrik Jensen: 开放性以及与多个平台集成的能力是 Opentrons 产品的一个非常重要的优势。

Brian Sørensen: 我们已经与 Opentrons 的产品开发团队讨论了我们产品之间进一步集成的方式,以便为我们的客户提供无缝衔接的工作流程并提高用户效率。这个需求目前在市场上需求量很大。我们在客户中看到的趋势是:他们对量化和准确性的需求与日俱增;且越复杂的实验室工作流程,要求就越多……而且消除错误源的需求也越大。实验室自动化的驱动力不是自动化本身,而是它可以提供最高质量的实验数据。

Henrik Jensen: 自动化不仅仅是为了给实验室创造更便宜、更易于使用的产品。我们必须考虑如何实现自动化的方法,必须考虑整个实验过程。

Brian Sørensen: 生物技术公司长期以来一直在努力解决这个问题。客户正在寻找可以帮助他们做出决定的东西。他们能尽快找到解决方案,他们的开发过程就越高效。这是该过程中的一个重要突破。

点击这里下载 Fidabio 的软件说明Opentrons 集成信息

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