如何使用 Opentrons Flex 实现高通量 NGS 文库制备?

在现代基因组学研究中,高通量测序(NGS)已成为关键工具,而文库制备流程往往繁琐、耗时且易受人为操作差异影响。Opentrons Flex 工作站作为一款模块化液体处理自动化平台,能够帮助实验室实现 NGS 文库制备的高通量、标准化与可重复性操作,显著提高实验效率和数据质量。

如何使用 Opentrons Flex 实现高通量 NGS 文库制备?

移液工作站

Opentrons Flex 的核心优势

Opentrons Flex 采用模块化设计,兼容多种管架和实验板类型,支持多通道移液和可定制化程序。通过图形化界面或 Python 脚本,研究人员可以快速构建 NGS 样品制备流程,包括 DNA/RNA 提取、片段化、接头连接、纯化及扩增等步骤。其精确的液体处理能力和自动化操作,能最大限度减少人为误差,提高样品处理一致性。

高通量文库制备流程示例

在使用 Opentrons Flex 进行 NGS 文库制备时,典型流程包括以下几个环节:

样品准备与分装

将 DNA 或 RNA 样品按照实验板格式分装到工作站指定位置,确保每个样品编号和管架位置清晰标注。

片段化与端修

通过自动移液加入片段化试剂和反应缓冲液,Flex 工作站可按照设定程序精确混匀和分配反应液,保证每个样品反应均一。

接头连接与纯化

自动化完成接头连接及酶反应步骤,随后使用磁珠或柱式纯化方法去除多余试剂和副产物。Flex 工作站可设置多轮洗涤和磁珠分离,减少手工操作误差。

文库扩增与检测

PCR 扩增文库,Flex 可实现反应液体的精准分配。扩增后的文库可进行质控和浓度检测,确保后续测序稳定性。

提升高通量文库制备效率的建议

合理规划板布局:根据样品数量和实验设计,合理设置样品和试剂位置,减少重复操作。

优化液体处理参数:根据试剂粘度和体积调整吸液和排液速度,以保证移液精度和混匀效果。

定期校准设备:保持机械精度,减少批次间差异。

结合磁力架或温控模块:增强纯化和反应效率,实现端到端自动化。

通过这些措施,实验室可一次性处理数十至数百个样品,实现真正高通量的 NGS 文库制备。

高通量自动化的优势

使用 Opentrons Flex 自动化 NGS 文库制备,实验室能够显著节省人力和操作时间,同时提升文库一致性和数据可靠性。减少手工操作不仅降低了操作失误风险,也减少了样品和试剂浪费,使高通量测序研究更具经济性和可重复性。

结语

高通量 NGS 文库制备对实验室效率和数据质量至关重要。Opentrons Flex 工作站通过模块化设计、精确液体处理和高度可定制化流程,为实验室提供了可靠的自动化解决方案。合理规划操作流程、优化设备参数和严格管理样品,可让实验室在保证数据质量的前提下,实现大规模、高通量的文库制备,为基因组学、转录组学及精准医学研究提供坚实支持。

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