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Opentrons Flex 自动化移液工作站24 小时全程自动化轻松制备高达 384 个质粒文库

简介
高通量基因组分析是生命科学研究中不可或缺的重要工具,这项技术在推动科研进步方面发挥着
至关重要的作用。为了满足了科研领域对高效、准确制备方法的迫切需求,seqWell 的 Express Plex™
Library Kit 提供了一种专门用于高通量制备质粒和扩增子文库的解决方案。
在传统的手工制备文库方法中,完成 96 个样品的制备需要耗费长达 90 分钟的时间,其中手动操
作时间占据了 30 分钟。这种方式不仅效率低下,还容易因为人为因素引入误差。
为了改进这一状况,本文对比了两种文库制备方法,一种是在 Opentrons Flex™ 移液工作站上使用
seqWell ExpressPlex™ Library Kit ,另一种是手工制备文库。
通过结合 Flex 移液工作站与 seqWell ExpressPlex™ Library Kit,我们可以显著缩短文库制备时
间,提高样本通量。这种自动化的解决方案不仅提升了制备效率,还降低了人为误差的风险,为生命科学
研究提供了更为可靠、高效的工具。
材料与方法
ExpressPlex 工作流程:
根据 Express Plex 的工作流程,我们在 Flex 自动化移液工作站上进行文库制备。实验过程中,我们输入
16 ng 的 pUC19 ,再将所有组分加入反应板 , 用 3000 rpm 的转速混匀 90 秒,然后进行后续的文库制
备和混合步骤。最终的文库在 NextSeq 2000 测序仪上进行 2X150 bp 测序。

ExpressPlex 工作流程

图 1.
A ) Express Plex 工作流程包括将 index 和 DNA 加入 反应板(已含有酶等混合物),然后进行扩增、混合
和 MAGwise 磁珠纯化;
B ) Flex 工作站包括吸头盒、模块、转板抓手和其他配件;
C ) Flex 工作站板位设置,用于在扩增后将 4 个反应板进行文库混合。

结果

Opentrons Flex显示结果

图 2 . A ) 结果显示 96 孔板中文库数据变异系数( CV )为 12.7%; B ) 95% 的文库数据通过了数据预处
理,为高质量数据,且超过 90% 文库质量得分达到 Q30; C ) 由 Flex 制备的文库比手动制备的文库浓度
更高。

独立的 96 混 1 文库

图 3 . 利用错开的开始时间,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小时内制备 8 个独立的 96 混 1 文
库。在 Flex 上设置第一块反应板后,可以在 24 小时内完成 768 个文库的制备。

结论
在 Flex 移液平台上制备的 96 个 pUC19 质粒样本文库呈现出了高度均一的质量,充分证明了 Flex
平台在自动化文库制备方面的卓越性能。
与手动制备相比,自动化文库制备不仅稳定性更佳,而且文库浓度更高。此外,超过95%的读数成
功通过测序仪质检 PF,这进一步验证了自动化制备流程的高效性和准确性。
Flex 移液工作站支持在单次运行中处理多达 384 个样本,极大地提高了样本处理效率。通过合理
安排时间,我们甚至可以在 24 小时内处理高达 768 个样本,从而满足大规模高通量基因组分析的需求。
在 Flex 平台上自动化 ExpressPlex™ Library Prep Kit 工作流程,我们实现了从提取的质粒/扩增
子 DNA 到数据生成的全流程自动化。这一解决方案不仅简化了操作步骤,降低了人为误差,而且显著提
高了实验效率和数据质量,为生命科学研究领域的发展注入了新的动力。

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