Opentrons Flex 实现无人值守 NGS 文库制备技巧

随着高通量测序(NGS)技术的发展,实验室对文库制备的效率和精度要求越来越高。传统手工操作不仅耗时,而且容易出现人为误差,影响数据质量。Opentrons Flex 自动化平台通过模块化设计和灵活编程,帮助实验室实现无人值守的 NGS 文库制备,提高实验效率和数据可重复性。以下是使用 Opentrons Flex 实现无人值守 NGS 文库制备的一些关键技巧。

Opentrons Flex 实现无人值守 NGS 文库制备技巧

移液工作站

规划自动化工作流程

在使用 Opentrons Flex 进行 NGS 文库制备前,首先需要规划实验流程。包括样品接收、建库反应体系准备、文库纯化、定量和板式转运等步骤。通过将每个操作模块化,Flex 系统可以在无人值守状态下连续执行任务,最大化利用设备资源,同时确保每一步骤的准确性和稳定性。

合理利用模块化设备

Opentrons Flex 支持多种模块组合,如移液器模块、磁珠模块、加热/冷却模块以及 Flex Stacker 样品搬运模块。在文库制备中,可以将磁珠清洗步骤与移液操作自动化结合,减少手动操作次数。加热/冷却模块用于酶反应和样品保存,确保温控精度,从而提高文库构建效率和质量。

编程和脚本优化

无人值守操作依赖于 Flex 系统的软件控制。用户可通过 Opentrons App 编写和调试自动化脚本,实现样品加液、混匀、分装等动作的精确控制。脚本编写时,应考虑移液速度、混匀次数、反应时间等参数,以保证反应均一性和文库产物的完整性。同时,合理安排任务顺序和模块调用,避免资源冲突和空闲等待时间。

样品管理与追踪

无人值守操作容易出现样品混淆风险。Flex 系统可结合 Flex Stacker 模块和条码识别功能,实现样品的自动搬运和位置记录。通过软件追踪每个样品的状态和位置,不仅减少人为错误,还能生成完整的实验记录,为后续数据分析提供可追溯性。

节省操作时间与提高效率

自动化 NGS 文库制备能够显著节省实验时间。Opentrons Flex 可连续执行多个样品处理任务,无需人工干预,特别适合高通量实验需求。通过合理安排批次和模块使用,实验室可以在夜间或无人值守状态下完成文库制备,提高整体实验效率。

保持实验环境与设备维护

无人值守操作仍需保证实验环境整洁与设备状态良好。建议在操作前检查移液器校准、模块清洁和耗材准备情况。保持恒温、湿度适宜的环境,有助于保证酶反应和样品处理的稳定性,避免因设备或环境问题影响文库质量。

结语:无人值守操作实现高效可靠的 NGS 文库制备

总体来看,Opentrons Flex 通过模块化设计、自动化脚本和样品管理功能,使 NGS 文库制备能够实现无人值守操作。合理规划工作流程、优化脚本参数、结合模块化硬件,可以提高实验效率、减少人为误差,并确保文库质量。对于追求高通量、精准和可重复性的实验室而言,Flex 平台提供了可靠的解决方案,使科研人员能够专注于分析与创新工作,而非重复性操作。

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