为何需要自动化核酸制备

核酸分离是分子生物学的一项基石技术。许多实验室为此使用手动纯化方案,但它们有四个缺点。
核酸分离是分子生物学的一项基石技术,为大多数湿实验室应用提供起始材料。然而,分离材料只是成功的一半。分离核酸的纯化对于可靠和一致的数据以及整体实验成功同样重要。例如:

去除可能干扰下游反应的抑制剂和杂质,例如 PCR 和逆转录酶抑制剂。抑制剂和杂质可能来自样品本身(例如,在复杂的环境样品的情况下)、分离过程中使用的化学品(例如,洗涤剂、有机溶剂)和/或工作区域中的污染。
纯净的起始材料对于 NGS 样品制备至关重要。在靶标富集、文库构建和尺寸选择过程中存在的任何杂质或不需要的材料(例如,引物二聚体)都可能导致伪影,使测序数据变得毫无意义,可能导致大量时间和金钱的损失。

自动化核酸制备


从反应混合物和琼脂糖凝胶中纯化所需的 PCR 扩增子、质粒、限制性消化的 DNA 片段和 RNA(例如小 RNA 物种)是各种应用的先决条件技术,包括克隆、基因改造、RNA 和 DNA 表征、体外转录和翻译等。
手动纯化方案有其缺点
如今,分子生物学家有多种易于使用的试剂盒可供选择,这些试剂盒可以从几乎任何可以想象到的样品类型中进行无缝核酸分离和纯化。然而,虽然这些试剂盒中的许多在纯化核酸方面非常有效,但它们通常是为手动操作而设计的,这带来了几个问题:

污染风险。与所有涉及移液的手动工作流程一样,手动纯化存在样品间交叉污染的风险。使用多通道移液可以降低这种风险,但此选项仅适用于基于板的方案。即使使用多通道移液,有时也难免会出错,尤其是在处理多个轮次的相对大量样本时可能产生的疲劳。
难以扩大规模。对于试管格式的方案,工作人员通常受到一次在离心机和其他必要设备中可以处理的试管数量的限制。一种常见的解决方法是分批处理大量样本,但这种方法速度慢,需要大量的动手工作。因此,手动净化对于大规模操作来说不是一种可行的选择。
容易出错。除了样本残留的风险外,手动方案还存在其他错误风险。想象一下这样一个场景:您已经标记了 24 个样本管,但在对工作台进行消毒时,方案进行到一半时标签被洗掉了。在试图将污染风险保持在低水平时,这是一个很容易陷入的陷阱,但很难从中恢复过来。这种情况可能会毁掉整个实验。
耗时。短时间的孵育步骤和短暂的离心旋转使得每次运行的可操作时间非常短,而批量处理样品的需求将占用您更多的宝贵时间。如果纯化是实验室工作流程的常规部分,它可以帮助您的实验室成员更好地利用他们的时间。
自动化消除手动过程错误并提高速度和生产力
上述问题可能会单独或组合影响数据质量和实验输出。如果您正在研究核酸,您已经知道纯化的重要性。选择自动化设置将允许您解决与手动协议相关的问题,帮助您获得一致的数据,最大限度地减少错误,提高速度和吞吐量,并让您有更多的可操作时间花在其他更令人兴奋的实验室任务上!从长远来看,您的实验室甚至可以通过投资自动化来节省资金。

那你还在等什么?有了移液机器人和正确的方案,您可以期待实现以下程序的自动化:

PCR 产物纯化
质粒纯化
酶促和标记反应后的 DNA 和 RNA 清理
NGS 文库清理
PCR 抑制剂去除
还有更多!
入门
正如我们上面提到的,当您拥有一个触手可及的机器人时,一切皆有可能。大多数纯化程序都可以适应自动化。您需要做的就是弄清楚方案,但您不需要独自完成这项工作。如果您正在考虑为您的实验室实现自动化,请与我们联系。我们很乐意帮助您完成它。

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