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在进行蛋白质研究时,蛋白质样品制备是实验中至关重要的一步。它直接影响到实验结果的准确性和可靠性,因此了解蛋白质样品制备的原则显得尤为重要。蛋白质样品制备不仅需要精确的操作,还需要根据研究目标选择合适的处理方法,确保样品在提取、纯化、保存等过程中不受污染和降解。
一、一致性与防止降解
1、保持一致性:在整个实验过程中,应尽量保持样品处理的一致性,以避免引入人为误差。使用相同的方法和条件来处理不同的样品,包括对照组和实验组。
2、防止降解:蛋白质样品在采集后应立即处理或冷藏保存。冻存样品时,应使用液氮或-80°C的冷冻器,以防止蛋白质降解。在制备样品时,尽量保持样品处于低温,以减缓蛋白质降解的速度。可以在冰盒中操作或使用冷却设备。避免长时间的离心、曝露于高温、pH改变或酶活性的存在,以减少蛋白质降解。
二、溶解度与杂质去除
1、提高溶解度:选择适当的缓冲液溶解蛋白质,pH值应符合蛋白质的最佳溶解条件。通常使用Tris-HCl、PBS、或HEPES等缓冲液,确保所有待分析的蛋白质样品全部处于溶解状态,且稳定可重复。
2、去除杂质:尽量去除干扰下游应用的杂质,包括但不仅限于核酸、组织碎片或某些高丰度无关蛋白。这些杂质可能会影响蛋白质的浓度测定、电泳迁移率以及与其他分子的相互作用等。
三、根据下游实验选择提取方法
1、提取方法的选择:根据下游实验的具体要求,选择适合的蛋白质提取方法。例如,如果需要分析蛋白质的磷酸化状态,则应使用能够保持蛋白质磷酸化的提取方法。
2、提取蛋白的类型:根据实验需求,决定提取变性蛋白还是活性蛋白,以及提取总蛋白还是亚细胞结构组分蛋白。亚细胞结构分离可以提高低丰度蛋白质的上样量,降低检测难度,还可以针对某一细胞组分的蛋白质进行分析。
四、样品处理与记录
1、样品处理:在制备过程中,应注意使用洁净的工作台、实验器具和手套,避免样品受到污染。所有工具、试剂瓶口和管子都应保持干净。
2、详细记录:在整个样品制备过程中,应记录详细信息,包括样品来源、处理步骤、浓度等,以便在后续实验中追踪和分析。
五、蛋白定量与变性
1、蛋白定量:测定蛋白质样品的浓度非常重要,以便在后续实验中使用正确的样品量。可以使用Bradford、BCA或Lowry等方法来测定蛋白质浓度。
2、蛋白变性:根据实验需求,可能需要对蛋白质进行变性处理。常用的变性剂包括SDS等,同时可以通过加热使蛋白质变性。
蛋白质样品制备需要遵循一系列原则以确保样品的质量和一致性,从而获得可靠的实验结果。这些原则涵盖了从样品采集到处理、溶解、杂质去除、提取方法选择、样品处理与记录以及蛋白定量与变性等各个方面。
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