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未来生命科学实验室将需要自动化、开源技术、人工智能和许多其他新兴领域的技能。以下是您需要了解的内容。
在 21 世纪初期,分子生物学、细胞生物学和蛋白质组学的湿实验室技能是任何寻求生命科学工作的人的关键。虽然这些领域的专业知识仍然必不可少,但未来的实验室将需要根据研究和技术的新兴趋势而不同的技能组合。
以下是我们认为有助于您熟悉的六个技能领域,以推动您的职业发展并为未来的生命科学实验室做好准备。
自动化为生命科学研究人员提供了显著的优势,包括提高数据质量、提高成本效率、可扩展性,以及有更多的时间去做实验室中重复实验以外的其他事情。自动化还有利于新一代测序或质谱蛋白质组学分析等新的复杂生物技术,这些技术需要越来越复杂的工作流程,有时过于复杂和耗时,人们无法成功执行。随着药物发现、诊断甚至基础研究对速度和吞吐量的需求不断增加,自动化的创新和能力正在激增。
鉴于全自动化工作流程的巨大潜力,许多研究实验室正在将科学家从实验室工作中抽离出来——将他们从工作台上拉下来,放在电脑前,设计实验让实验室机器人完成,而不是自己执行。这更有效地利用了科学家对生物学的理解,将重复的实验室工作留给机器人,这样生物学家就可以解决困难的科学问题。
Ginkgo Bioworks 为客户设计定制生物体,并建立自己的工厂,利用软件和硬件自动化来扩展该流程。Synthego 是第一家也是唯一一家提供全栈基因组工程解决方案的公司,通过利用基于云的软件自动化来实现这一目标。Synthace 同时利用硬件和软件来帮助大型自动化实验室。当然,世界各地有数百名生物学家使用 Opentrons 软件和硬件来自动化各种实验的协议和工作流程,从基本稀释到 PCR 制备和 NGS。探索这些公司如何使用自动化将有助于您了解自动化如何改变生命科学研究。
开源是指源代码可供任何人免费查看、使用、修改和共享的软件。它允许用户在现有代码的基础上进行构建和学习,同时促进和鼓励世界各地用户之间的协作和创新。
生命科学领域的开源应用程序用于吸收基因组学和其他相关应用程序产生的大量数据集,例如 Ensembl 基因组浏览器数据库,任何感兴趣的用户都可以访问基因组和其他相关数据。开源计算技术也被用于建模和模拟生物体:OpenWorm 使用它来创建虚拟线虫,而 Virtual Cell 使用它来建模和模拟细胞,流行病学研究人员共享基因组数据以加快病原体分析并确定爆发源。
随着生命科学学科中开源的使用不断发展,编码和数据共享方法方面的实践专业知识将成为生命科学家的主要资产——因此,现在熟悉其中一些工具将为您在未来提供优势。开源协议共享平台是一个很好的起点,例如 Protocols.io 和 Opentrons 协议库,它们允许科学家发现和共同开发协议,以及 Plasmotron.org,它允许用户在开源代码的基础上进行构建。
能够有效地向非技术受众传达生命科学研究的应用和影响,在科学家与社会之间建立了重要的联系。这一领域的有效沟通包括使用非技术性的、朴实无华的语言,使概念易于理解,以及学习如何接触和吸引公众。实践这两个学科可以鼓励重要的讨论和辩论,并使有关科学发展的知识透明且人人都能获得。您可以加入致力于改善科学传播的数千名生物学家,通过参加自愿的科学推广活动、在社交媒体上分享您的研究活动或创建自己的科学博客或播客来磨练您的科学传播技能。
在生命科学领域,机器学习已经通过其区分细胞、分析基因组数据、进行图像分析和比以前的方法更早、更灵敏地检测疾病指标的能力,彻底改变了研究和诊断的速度。一个主要的增长领域是利用机器学习来设计实验。Asimov 使用开源数据开发机器学习算法,将大规模数据集与生物学机械模型联系起来,以构建生物电路实验。Cello 利用机器学习来自动设计活细胞中的生物电路。另一个主要的增长领域是生物信息学。 Deep Genomics 利用机器学习来收集、分析和处理基因组数据,以开发更好、更有针对性的药物。一些公司,如 Atomwise,甚至使用深度学习框架尝试在软件中筛选候选药物。熟悉这些新兴应用将有助于您掌握该技术的未来用途。
预计到 2023 年,全球 CRISPR 市场将增长 6 倍,达到 30 亿美元,因此未来生命科学实验室中利用基因编辑工具的机会应该不胜枚举。
单细胞分析领域的增长受到基础研究以及对早期疾病检测技术、产前筛查、生物标志物发现、液体活检和生物药物开发日益增长的需求的推动。
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