DNA稀释

一种降低DNA浓度的方法,以更好地适应各种生物学程序,如聚合酶链反应(PCR)、DNA测序、分子克隆和实时聚合酶链反应(qPCR)。

稀释 DNA 通常是通过标准稀释、系列稀释或使用分光光度计进行的,对精度和准确性要求很高,人工移液面临的挑战包括不准确、DNA 降解和交叉污染。通过液体处理系统实现自动化可提高准确性、可重复性、效率和吞吐量,同时降低污染风险,从而改善流程。

稀释 DNA 的工作流程

各种工作流程都需要稀释 DNA,例如:

  1. 聚合酶链式反应 (PCR):PCR 需要特定浓度的 DNA 作为起始材料
  2. DNA 测序:Sanger 和下一代测序(NGS) 都需要特定的 DNA 浓度
  3. 分子克隆:DNA稀释对于优化连接反应是必要的
  4. 定量 PCR (qPCR):与 PCR 类似,qPCR 需要最佳 DNA 浓度才能进行准确定量。

DNA 稀释从未如此简单

OT-2 是一款台式液体处理器,其设计足够方便且灵活,可以自动化许多常见的应用。

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稀释 DNA 的最佳方法1.  标准稀释: 将特定体积的 DNA 添加到缓冲溶液中以降低浓度。
2. 连续稀释: 在此过程中,先进行初始稀释,然后逐步进行进一步稀释。这允许使用一系列浓度来优化实验条件。3.  使用分光光度计稀释:使用分光光度计测量DNA浓度,然后使用缓冲溶液将DNA稀释至所需浓度。

协议聚焦

Opentrons 可帮助您使用 OT-2和 Opentrons Flex 的开源协议自动进行 DNA 稀释

为何稀释 DNA 如此困难?

由于需要精确度和准确度,稀释 DNA 可能具有挑战性。测量中的小错误可能会导致最终 DNA 浓度的显著差异,从而影响下游应用。此外,DNA 容易降解和污染,这可能发生在稀释过程中。

使用手动移液稀释 DNA 的主要挑战

  1. 不准确和不精确:移液时的细微差别可能会导致 DNA 浓度出现重大差异。
  2. DNA 降解:如果处理不当,DNA 可能会在此过程中降解。
  3. 交叉污染:如果移液器没有正确清洁,则存在交叉污染的风险。

自动化 DNA 稀释过程

自动化液体处理系统可用于自动化 DNA 稀释过程。这些机器可以准确分配精确量的 DNA 和稀释剂,从而降低人为错误的风,险并提高可重复性。自动化方案可以轻松调整以创建一系列 DNA 浓度。

自动化比手动移液稀释 DNA 的优势

  1. 提高精确度和准确性: 与手动移液相比,自动化系统能更精确地处理极小体积和高浓度的 DNA。
  2. 时间效率高: 自动化系统可同时稀释多个样本,大大减少了稀释过程所花费的时间。
  3. 降低污染风险:自动化系统可将交叉污染和 DNA 降解的风险降至最低。

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