NGS実験プロセス

今日のテクノロジーの急速な発展に伴い、NGS（次世代シーケンス）テクノロジーは、スループットが高い、効率が高く、精度が高いため、生物医学研究の重要な地位を占めています。最先端の遺伝子シーケンス技術として、NGSはゲノミクス、トランスクリプトーム、およびその他の分野の開発を大幅に促進しただけでなく、疾患の診断、治療、予防に対する強力なサポートも提供しました。

ngs実験プロセス

1 DNA抽出と品質検査 1。 2。DNA抽出：フェノールクロロホルム抽出法、磁気ビード法などの適切な抽出方法を使用して、サンプルにDNAを抽出します。 3。品質検査：DNAの濃度、純度、および完全性は、電気泳動、分光光度計などによって検出され、DNAの品質がその後の実験結果の要件を満たすようにします。

2つのライブラリ構造 1。 2.リンカーの追加：DNAフラグメントの両端に特定のリンカーシーケンスを追加します。 3。PCR増幅：リンカーシーケンスをテンプレートとして使用して、PCR増幅によって十分な数のDNAライブラリが取得されました。

3。特定の領域（エクソームシーケンス、ゲノム固有の領域シーケンスなど）のシーケンスプロジェクトのターゲットキャプチャこのステップは、シーケンスデータの精度と深さを改善することで、遺伝子または関心のある領域のよりターゲットを絞った分析に役立ちます。

iv。 2。シーケンス反応：シーケンサーは、合成、シーケンス、ライゲーション、シーケンスの方法を使用して、ライブラリの核酸断片を配列決定します。シーケンスプロセス中、シーケンサーは蛍光標識DNTP（デオキシリボヌクレオシド三リン酸）を徐々に導入し、蛍光信号を監視して各位置で塩基タイプを決定します。 3。画像キャプチャとデータ分析：高解像度カメラを使用して蛍光信号の画像をキャプチャし、バイオインフォマティクスソフトウェアを介して画像とシーケンスデータを処理および分析して、完全なシーケンス結果を取得します。

5つのデータ分析> 1。 2。二次分析：基本品質のスコアリング、シーケンスアライメント、バリエーション検出、その他のステップなど、ほとんどの場合、機器によって自動的に完了します。 3。第3レベルの分析：VCFファイルの処理を伴い、最終的なシーケンスの結果と生物学的意義を得るために、遺伝子注釈、バリアントフィルタリングなどのパーソナライズされた調整を行うことができます。

6データ分析の結果に基づいて、解釈と報告、単一ヌクレオチド多型（SNP）、挿入または欠失、構造的変動など、シーケンスデータの変動情報を解釈し、関連するデータベースと文献情報を組み合わせて、生物学的重要性の報告を提供します。

NGS実験プロセスは、DNA抽出、ライブラリ構築、ターゲットキャプチャ（オプション）、コンピューターシーケンス、データ分析などをカバーする複雑で詳細なプロセスです。各ステップは重要であり、結果の結果の精度と信頼性を確保するために、厳密な技術的運用と品質管理が必要です。

関連する読書の推奨事項

opentronsピペット熱循環モジュールGen2

Pipetting Robot Instrument Services Servicesの概要

自動ngsライブラリ準備e-book

ポリメラーゼ連鎖反応の原理とプロセス

第二世代遺伝子シーケンスの原則は何ですか？

C18 Chromatographic Column の使用方法