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2019 年 22 月 4 日

開源在生物學中的力量 - DAMP 實驗室的 10,000 美元生物工廠

一個強大的生物工廠不需要數百萬美元的投資——經濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現這些功能。

DAMP 實驗室是波士頓大學生物設計中心內一個新創的生物工廠。該實驗室僅使用不到 10,000 美元的開源軟體和硬件，就為科學界提供了 30 種合成生物學方案（如DNA組裝、轉化、測序和質粒純化等），並以此收取服務費。任何科學家都可以透過造訪 DAMP 實驗室的網頁介面遠端指定實驗計劃，其自動化系統能夠設計、建置和測試該計劃。

他們是如何做到的呢？

透過整合一系列開源工具，DAMP實驗室能夠快速開發一個複雜的系統，該系統能夠高效且優雅地自動化執行生物迴路測試。其中一些關鍵的開源工具包括：

  • cello 使用Verilog编程语言实现生物回路的自动化设计。
  • aquarium 用于实验室信息管理系统（LIMS），实现作业排队和库存管理。
  • open TR ONS 的OT-2移液机器人：用于自动化DNA组装、转化和其他许多方案。

您可以在 Synbiobeta 部落格上了解更多關於 DAMP 實驗室技術堆疊的資訊。

為什麼DAMP實驗室的生物工廠和開源技術如此重要？

DAMP實驗室在影片中談到了開源技術和它賦予的能力。

該專案展示了開源軟體和硬體在實驗室中的力量。如果手動執行所有這些流程，DAMP實驗室需要一週時間來設計、建造和測試10個基因迴路。透過在開源技術上投入相對較少的資金，DAMP實驗室的吞吐量提高了10倍。

結果就是，DAMP實驗室能夠用相同的設施和團隊執行10倍的實驗。開源工具提高了生產效率，大大降低了執行複雜實驗的成本。

一個強大的生物工廠不需要數百萬美元的投資——經濟實惠的開源工具讓每個實驗室都有可能實現這些功能。

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