Retro Biosciences使用OT-2自動化單細胞RNA定序文庫製備

單細胞 RNA 定序能夠以單細胞為單位進行轉錄組學分析，這項研究可以讓我們進一步了解一些稀有且貴重的細胞群。儘管單細胞RNA定序技術的使用越來越廣泛，但這項技術的成本仍然相當昂貴。除了定序平台和每次單獨運行的成本外，文庫製備步驟既昂貴又費力。然而，把文庫製備步驟進行自動化可以有效減少實驗結果的變異性，同時節省研究人員的寶貴時間，解放他們的雙手，讓科學研究人員能有更多時間用來設計實驗或分析數據。

目前，市面上能實現單細胞RNA定序的自動化文庫製備成本高達 26萬美元，昂貴的成本已經超出了市面上大部分小型研究實驗室的預算。為了向更多實驗室提供這項自動化技術，Retro Biosciences 成功「破解」了 Opentrons 的 OT-2 自動化移液平台，使其能夠實現自動化文庫製備功能，同時成本僅為 2.6萬美元！節約了10倍的啟動成本。

Retro Biosciences 是一家位於加州的生物醫學公司，專注於血漿療法、細胞重編程和細胞自噬研究。

Q: 請簡單介紹一下Retro Biosciences 公司？ A: Retro Biosciences 的成立最初是一家臨床治療藥物研發公司，後來主要業務是開發預防性藥物來解決細胞老化問題。大多數研究老化的生物學公司都專注於單一的衰老機制，而 Retro Biosciences 是一家多專案公司，我們努力探索的三種療法有：細胞重編程、自噬和血漿啟發療法。我們了解到醫院接診的病人有 80% 以上的疾病負擔源自於老化機制，因此我們希望找到能直接解決這些問題的療法，幫助更多病人。

Q: 自動化如何幫助您達成目標？ A: 機器自動化是不知疲倦的，可以持續性工作，同時自動化的效率顯著超越人工。我們正在探索未知的生物學，其中一些探索涉及到的參數以及參數組合非常廣泛，如果繼​​續讓科學研究人員使用手動的方式進行實驗，我認為這是對研究者科學頭腦的浪費。

Q: 您為自動化單細胞RNA定序的文庫製備創建了一個非常酷且非常實惠的解決方案。請告訴我們您創造這個方案的初衷，以及您是如何做到的？ A: 文庫製備對我們來說是一個入門項目。自動化的最大優勢是你可以將那些固有的、大量重複的、最不希望出錯的環節自動運作起來，節省時間，減少人工失誤。我們在這裡做了很多單細胞RNA定序。每一次測序我們需要面臨的分析和研究任務都很重，因此我們必須開發新的軟體功能（例如液位特定移液）和硬體功能（例如改進的磁珠分離系統），它使我們能夠直觀地審查協議中的所有步驟，以發現錯誤並驗證品質。

Q: 您在Github < /strong>上發表了這項工作，引發了不錯的反響， 您為什麼決定公開這項工作？ A:對我們來說，在廣泛的生物學研究中降低科研成本對社會的好處，遠遠超過了我們對同行的競爭關係的狹隘擔憂。我們希望有更多從事同類研究的科學研究者可以從自動化中獲益。

Retro Biosciences 透過展示Opentrons開源自動化移液系統創造了屬於自己的單細胞定序文庫製備自動化流程，幫助了更多研究單細胞定序的實驗室能夠啟動自動化，提升他們的研究效率。我們的開源自動化程式可以透過程式設計來完成研究人員需要的任何事情，同時把成本控制在較低的範圍內。我們被 Retro Biosciences 引領的創新所震撼，期待他們未來的持續創新。