Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能
看詳情Fidabio是一家由哥本哈根大學的研究人員創立的生物技術公司,坐落於丹麥,核心業務是幫助科學研究工作者推進複雜的生物學項目,例如多重結合蛋白、脂質體、外泌體和雙特異性研究項目。 Fidabio發明的FIDA技術可在天然條件下對蛋白質和奈米顆粒進行簡單、準確和快速的檢測和表徵。
今天我們採訪的是 Fidabio 的 CEO Brian Sørensen 和 CSO Henrik Jensen。為了創建一台用於分析生物藥物開發過程中的蛋白質間相互作用的設備。他們使用了Opentrons OT-2 自動化移液機器人和Opentrons Python API 以及他們自己的軟體整合創建了用於樣品製備的複雜稀釋工作流程。 Brian Sørensen 和 Henrik Jensen 會為大家分享他們的 OT-2 的使用體驗。
Opentrons: 請您介紹一下您的研究背景。
Brian Sørensen: 我們一直在哥本哈根大學工作,直到去年年底。
Henrik Jensen: 在大學裡,我們使用OT-2自動化移液平台進行樣品製備工作流程中的梯度稀釋工作。我認為 OT-2 自動化帶來的便利性有助於在實驗室內進行整體整合。
Opentrons: 您的研究計畫是什麼樣的?
Brian Sørensen: 我們的內部試驗通常是小型實驗,手動移液也是可以滿足的。但是,當我們的客戶需要進行大型實驗時,讓技術人員僅靠提升手動移液速度來實現是不可行的。機器人可以取代人工移液,科學研究人員可以把這些時間省下來用來做實驗分析。一旦實驗涉及更大的稀釋系列,或需要分裝更多樣品時,就需要用到自動化。我舉一個例子,我有一個客戶分析了附近醫院的數千個病患樣本,這麼大批量的操作是需要透過自動化來實現的。
Opentrons: 為什麼選擇 OT-2?
Brian Sørensen: 我們購買了獨立的液體處理機器人,但很快就發現我們可以將其與我們自己的軟體整合。
Henrik Jensen: 自動化的優點我認為有以下幾點:第一,可以幫助我們處理大量的樣本。第二,在實驗室工作中,準確性也很重要。如果您能以標準化的方式進行工作,自動化有利於改善結果。
Brian Sørensen: 可重複性是關鍵,您在實驗室中人為因素越高,則可重複性就越低。
Henrik Jensen: 第三,如果您可以使用機器人,在整個工作流程中我們對操作員在知識和技能層面的要求將變得更小。
Brian Sørensen: 如果您只是做一些常規分析,那麼您可以手動完成所有工作。但這可能不是進行整個檢測的最佳方式,且無法更好地發揮技術人員的最大價值。
Henrik Jensen: 使用自動化移液平台,您可以更輕鬆地記錄您的研究,因為您可以共享移液腳本,研究人員可以重現數據。自動化能夠詳細呈現您的下一步操作以及歷史操作。
Brian Sørensen: 如果您想將您的實驗從實驗室轉移到另一個實驗室,並且實驗中有手動步驟 —
Henrik Jensen: —自動化要容易得多。這個因素也是我們將製備環節甚至整個工作流程變成自動化的根本原因之一。
Brian Sørensen: 最初整合OT-2時,我們認為它是一個不錯的小眾應用。但是,當我們看到更多客戶也有興趣將 OT-2 作為其 Fidabio 工作流程的一部分。我們可以在軟體中看到無縫整合更多實驗室的可能性。於是我們就把Fidabio的軟體和Opentrons連接在一起。
Opentrons: 您的OT-2的實際使用體驗如何?
Henrik Jensen: 從硬體的角度來看,它即插即用,非常方便。不過在協議方面還是有一些需要我們學習的地方,但其實這也不難。我們的軟體工程師 Morten 自己編寫了腳本。腳本的創建實際上非常簡單。
Brian Sørensen: OT-2 可以無縫融入我們的工作流程。它簡化了生成結合曲線的工作。我們把大量重複移液的工作交給機器人完成而不是佔用技術人員的時間,節省了人力成本和時間成本。同時 OT-2 這非常適合我們的系統以及其他自動化實驗室系統。它是一個端到端的自動化工作流程。
Henrik Jensen: 我們之前沒有這方面的經驗。但是,由於我們自己也是儀器開發人員,我們已經對這個過程已經有了很好的理解。
Opentrons: 在購買OT-2之前,您使用過其他實驗室自動化設備嗎?您對實驗室自動化的流程有什麼期望?
Brian Sørensen: 當我們開發自己的平台時,高度自動化對我們來說很重要。從這個意義上說,OT-2 很好地增強了我們自己的一個關鍵賣點。它與我們自己平台中的關鍵元素之一非常吻合。
Opentrons: 您使用 OT-2 的特定用途是什麼,以及它如何融入您的工作流程?
Brian Sørensen: 對我們來說,我們銷售的儀器必須非常精確。我們知道我們的技術有能力提供非常準確的數據,但在生物學界,即使是很小的變化也會影響結果。尤其是我們使用的應用程式(例如藥物研發),我們必須確保我們盡可能多地控制實驗。為保障更好的實驗產出嚴格控制準備過程。
Henrik Jensen: 在我們整合之前,我們有一個分析開發合作夥伴,它允許我們將資訊輸入系統,系統會計算出您需要什麼來製作解決方案。以前我們是手動進行的。但接下來我們會用OT-2製作腳本,而不是手動進行。
Opentrons: 您是否有其他自動化項目的計畫?
Brian Sørensen: 我們一直在尋找進一步的發展。雖然我們公司還年輕,但我們正在快速發展期,未來可能會嘗試更多的整合和開發專案。
Opentrons: 關於使用 OT-2,您還有其他想分享的嗎?
Henrik Jensen: 開放性以及與多個平台整合的能力是 Opentrons 產品的一個非常重要的優勢。
Brian Sørensen: 我們已經與 Opentrons 的產品開發團隊討論了我們產品之間進一步整合的方式,以便為我們的客戶提供無縫銜接的工作流程並提高用戶效率。這個需求目前在市場上需求量很大。我們在客戶中看到的趨勢是:他們對量化和準確性的需求與日俱增;且越複雜的實驗室工作流程,要求就越多…而且消除錯誤來源的需求也越大。實驗室自動化的驅動力不是自動化本身,而是它可以提供最高品質的實驗數據。
Henrik Jensen: 自動化不僅僅是為了創造實驗室更便宜、更容易使用的產品。我們必須考慮如何實現自動化的方法,必須考慮整個實驗過程。
Brian Sørensen: 生技公司長期以來一直在努力解決這個問題。客戶正在尋找可以幫助他們做出決定的東西。他們能盡快找到解決方案,他們的開發過程就越有效率。這是過程中的一個重要突破。
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