Opentrons客戶訪談 | 動物健康實驗室Prairie Diagnostic Services Inc的Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu

本期客戶訪談我們邀請到了動物健康實驗室的Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu，他們將為我們分享他們使用Opentrons OT-2自動化移液平台進行包括MALDI-TOF MS目標製備在內的質譜應用。

Anatoliy Trokhymchuk 是 Prairie Diagnostic Services Inc. (PDS) 的首席科學家，該公司是薩斯喀徹溫大學 附屬的地區動物健康實驗室。 Mengying Liu 是PDS 處理流程改善與自動化工作流程開發的自動化研究員。她的自動化開發案例之一就是使用Opentrons OT-2 自動化移液平台進行質譜應用，包括MALDI -TOF MS目標製備。

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景。

Mengying Liu: 我是 PDS 的研究助理。我在中國農業大學獲得了獸醫博士學位，然後來到薩斯喀徹溫大學攻讀獸醫病理學碩士學位。我在一月底開始為 PDS 工作。我對電腦程式設計很感興趣，並將其與實驗室檢測相結合，我很享受在 PDS 學習的時光。

Opentrons: 你們的研究計畫是什麼？

Anatoliy Trokhymchuk: 我是一名獸醫，為一家地區性獸醫診斷實驗室工作，我日常工作需要與各種客戶和專案打交道。有些項目，如監測測試和疫情應對，需要進行大規模的檢測工作。我們在 PDS 有一群優秀的人才，我的工作是激勵他們，並為他們提供工作必備工具的必要支撐。

Opentrons: 為什麼您會選擇OT-2？

Anatoliy Trokhymchuk: 隨著我們工作量的增加和診斷方法的日益改變，我們需要在實驗室完成更多、更精確的常規、重複性任務，我們逐漸意識到自動化才是實驗室未來的趨勢。我們實驗室已經有了很多不同類型的機器人，我們也正在快速學習如何使用 OT-2。在不久的將來，我們將會有更多基於基因組的快速診斷工作，而自動化是完成這些工作的重要部分。

我認為人類在實驗室的主要目標是探索科學的邊界，並不斷嘗試科學創新。 – Mengying Liu

Opentrons: 你們使用OT-2做了哪些項目，它如何適應你們的工作流程？

Anatoliy Trokhymchuk: 目前 OT-2 在我們實驗室有兩個主要用途：一項是用於運行 Mengying 正在使用的自動化流程，另一項是作學習工具。我們正在學習如何優化協議和提高工作產出，以擴大我們的業務。作為一個科學研究工具而言，我們非常喜歡 OT-2，但我們更它賦予的更大的探索價值：如何將更大的任務自動化並將其整合到我們的工作流程中？

Opentrons: 在實驗室裡，您的日常工作是怎麼樣的？您會使用到哪些檢測方法？

Mengying Liu: 我的日常工作是致力於不同實驗室檢測的自動化流程開發和運行，例如 MALDI 目標塗層。我們的系統使用一個與製造商無關的 96 點靶。我在我們實驗室使用 OT-2 自動化移液平台創建了一個工作流程和協議。

在我們擁有 OT-2 之前，我們的操作員需要手動將基質滴加到 96 個孔中，做這個步驟時細菌樣本已經取樣到靶上了，這項工作其實很容易被機器人取代。此外，因為我們是診斷實驗室，我們必須確保沒有樣本污染，所以操作員每次操作都需要更換吸頭。 OT-2 可以精確地處理到 0.1 mm 的移液，使我們能夠不接觸樣品就滴加基質——我們整個靶只需要用到 8 個移液吸頭，減少了塑膠廢物。

實驗室不是一個整天在移液工作上浪費時間的地方，實驗工作需要有生產力和創造力。 – Anatoliy Trokhymchuk

此外，我們設計的協議很容易設定。這就是我們使用 OT-2 的原因：技術嫻熟的技術人員可以在 5 分鐘內手動執行整套工作流程，OT-2也可以大致以相同的速度完成。但是 OT-2 的優點是不需要高度熟練的技術人員也可以執行相同的流程，這讓技術人員可以騰出時間做其他事情。我們正在努力在整個實驗室中標準化這一點。

我透過使用 Opentrons API 和自訂介面將 OT-2 連結到我們的 LIMS 系統以產生顯示對照品和樣品的板圖，我可以將其匯出為純文字檔案並上傳為我的協議。這節省了很多時間，並且可以輕鬆地與實驗室的其他工具整合。 OT-2 使用起來很容易，因為我只需要在開始時校準機器人一次，每次可以執行多達 8 個板。我正在探索 OT-2 的其他應用，讓它可以更輕鬆地投入其他實驗室的工作。

OT-2 具有不同的整合潛力，因此當完成 MALDI 工作流程時，我會用它執行其他工作流程。

Opentrons: 在疫情之前，您的常規日常工作是什麼？

Anatoliy Trokhymchuk: 我們現在在做的日常工作與疫情之前完全相同。然而，在疫情期間，我們需要在實驗室戴口罩，並遵循公共衛生部門規定的所有預防措施。我們認為我們的服務是必不可​​少的，儘管我們不知道這裡的疫情會發展到什麼程度，也不知道我們的實驗室是否會被要求提供檢測支持，但我們的職能和工作沒有改變。我們沒有直接參與疫情應對，但我們在加拿大魁北克省地區的同行們將他們的動物衛生實驗室用於新冠病毒檢測。

Opentrons: 您有其他自動化專案的計畫嗎？

Anatoliy Trokhymchuk: 我希望看到我們實驗室的所有自動化工具能夠無縫地協同工作，然後我可以將很多常規的實驗室任務交給機器人去執行，而我們技術人員則負責過程監督、控制和開發應用程式。實驗室不是一個整天在移液工作上浪費時間的地方，實驗工作需要有生產力和創造力。

Mengying Liu: 那也是我衷心期望希望看到的未來​​！我相信有一天所有這些重複性的工作都將被自動化取代。我認為人類在實驗室的主要目標是探索科學的邊界，並不斷嘗試科學創新。不是把時間消耗在重複性的工作，而是做更多實驗創新等專案。

Opentrons: 關於OT-2的使用體驗，您還有什麼想分享給大家的？

Anatoliy Trokhymchuk: 關於實驗的工作流程設計，我們需要學習的地方還有很多，不只是自動化。這是一個循序漸進的過程。我們正在逐步學習，並且優先攻克主要項目。最終，將整個工作流程交給機器人平台是一個很好的想法，但我認為我們還很遠。儘管如此，由於 Opentrons 獨特的靈活性和開源特質，為我們提供了全流程自動化邁進的機會。

Mengying Liu: 我真的很喜歡 OT-2 的彈性。有些公司只設計用於 MALDI 的機器，但我們在 OT-2 上可以做很多不同的協議。