比利時生命科學實驗室VIB使用OT-2進行自動化NGS文庫製備

Stephane Plaisance, VIB的分子生物學家，倡導引入自動化技術來改進實驗室用於長讀長和短讀長測序的NGS文庫製備工作流程。

隨著定序服務的需求量成長，實驗室需要尋找能夠大幅提升工作產能的方法，而實驗室自動化就是簡化和擴展定序操作的有效措施。比利時領先的生命科學研究所之一VIB Nucleomics的分子生物學家Stephane Plaisance選擇Opentrons自動化移液平台，用於提升實驗室的NGS 文庫製備工作效率。

複雜而乏味的實驗室工作限制了實驗室效率

VIB Nucleomics 是一個以定序為核心業務的研究所，致力於為 VIB 研究人員以及研究各種生命科學學科的外部學術和工業研究人員提供服務。

VIB 的 NGS 分析專家Stephane Plaisance與其他九名實驗室科學家一起共同完成實驗工作，包括 NGS 文庫製備、在不同平台上進行長讀長和短讀長測序以及全基因組表達分析。幾年前，他的團隊面臨了實驗產出效率低的問題。冗長乏味的移液操作限制了他們的工作效率，並給他們的實驗室技術人員帶來了工作壓力。他們想用自動化來改善工作流程，但當時許多大型 NGS 機器人不具備能夠適應實驗室專案多樣性的能力。

「 我們開始關注大型、更昂貴的機器人，但這些機器人更適合高吞吐量的日常工作，而我們需要根據我們承擔的每個項目調整我們的流程。這是我們最終選擇Opentrons的原因，它具備較高的靈活性和性價比。

–Stephane Plaisance

VIB將實驗室自動化整合到定序核心工作流程中

在進行了全面的市場分析後，評估了產品性價比和使用靈活性，Stephane選擇了 Opentrons OT-2 自動化移液機器人，OT-2受到實驗室工作人員的一致好評。根據實驗室的特定應用需求，他們逐漸調整了最適合該實驗室的實驗流程協議。在他們購買了第一台OT-2後不到兩年，VIB Nucleomics 又購買了四台，現在有五台 OT-2 自動化移液機器人協助他們完成不同的實驗室任務。其中三台用於 Illumina NGS 文庫製備，負責自動化PCR前處理和後處理工作。

「 對於Illumina DNA 文庫準備，我們在專用的PCR 前處理實驗室中對一台OT-2進行初始樣本操作，然後我們將孔板從那個房間中取出進行PCR，然後我們使用第二台OT-2進行PCR後處理工作。

–Stephane Plaisance

一台OT-2用於研發，最後一台OT-2用於在文庫製備完成後對樣本進行重新混合。 OT-2的靈活性和Opentrons團隊提供的產品支持，再加上Plaisance和VIB團隊的創造力，使得對該設施投資推動實驗室自動化取得了巨大成功。同時，一個包含1萬個樣本的宏基因組計畫已經成功使用OT-2管線執行，更多的大型計畫即將到來！

了解更多關於在OT-2上自動化NGS文庫製備。