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染色體高通量定序分析

染色體高通量定序技術,透過對定序深度的調整,可以最小檢測到10kb的微缺失及微整復,打破了疾病研究過程中的通量限制,具有高分辨力、高敏感性和高準確性的優點。高通量定序技術對標本要求低,同時透過抽取母血進行對比分析可以排除母體細胞污染,在進行常規染色體核型分析的同時,可以留種材料,採用高通量測序技術對標本進行再次檢驗從而提高檢測成功率。

染色体高通量测序

遺傳學檢查通常分為染色體水平和基因層面的檢測。再再次強調臨床上絨毛取樣,羊水或臍血穿刺其實都是指取得胎兒樣本的手段而非檢測方法。取得胎兒樣本後根據不同的臨床指徵會選擇相應的檢測手段,如染色體培養核型分析,染色體拷貝數檢測,基因檢測等。目前臨床上染色體層面最常用的檢測方法就是核型分析和染色體拷貝數(CNV)檢測,而基因層面最常用的檢測方法有很多,例如高通量定序,Sanger定序,MLPA(多重連結依賴探針擴增),定量PCR等等。

如何找到適合的檢測方法?基因層面的檢測方法很多,都是相愛相生互相補,並不是說全外顯子就最全了,每種單基因病都有自己最適合的檢測方法。舉個例子:杜氏肌肉營養不良(DMD)目前首選的檢測方法是MLPA,而不是全外顯子檢測。因為70%以上的患童是因為DMD基因外顯子缺失所導致的。因此在檢測前醫師可能需要與檢測實驗室及或檢測機構充分溝通,給出患者及家屬最適合的檢測方法,而非「最貴」的「最全」。

國內產前基因檢測現況產前基因檢測目前幾乎只在國內大型醫院進行。臨床上常見的需要進行產前基因診斷的情況大概有三種:1、家裡有相關單基因遺傳病史,例如父母患病或生過患兒,並已經明確致病變異位點,為了避免胎兒再次患病;2、孕前篩檢發現異常:無遺傳病史,但懷孕或懷孕前做了某些篩查,例如夫妻雙方攜帶者篩檢、耳聾基因篩檢或脆X檢測等,發現了某些可能導致胎兒患病的位點;3、懷孕影像學發現異常,需要做產前基因檢測,例如胎兒四肢短小需要排除FGFR3基因突變(有進行此基因檢測的醫院較少)。

如何解讀基因檢測的報告?由於基因檢測的複雜性以及國內基因檢測及諮詢水平的地域差異大,準確的解讀相應的基因檢測報告並不是一件容易的事。但對於廣大孕婦來說,有個最簡單的看報告的方法,那就是在致病基因位點已經明確的前提下,我們只要看羊水檢測報告中的位點是與家裡病人的那個點相同還是與正常人相同就可以了:如果和家裡患者一樣,攜帶了一個或兩個或更多的致病性的位點,那說明胎兒還是患者;如果和正常人一樣,攜帶的不致病的位點,那就表示胎兒基本上就是正常的。但這是最基本的看結果方法,實際情況可能要複雜的多,因此還是要讓大家記住一句話:「基因層面的變異解讀及遺傳諮詢推薦到正規的產前診斷機構找專業的遺傳諮詢醫生。

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