使用 Opentrons Flex™ 核酸萃取工作站純化從細胞或組織樣本中提取基因組 DNA

應用優勢

使用 Opentrons Flex™ 搭配NucleoMag® Tissue 試劑盒，進行純化核酸的優點：

1.方法經過驗證，確保全自動提取純化過程準確性。 2.產量和純度重複性好，穩定回收基因組 DNA。 3.處理能力強，可同時處理最多 96個樣品。 4.可存取 Opentrons 協定庫或透過MACHEREY NAGEL 的自動化技術支援automation-bio@mn-net.com以取得更多詳細資訊。

導言

萃取基因組 DNA 是生命科學和應用測試實驗室中常見的實驗流程，尤其在基因分型測試、定序和臨床研究等下游應用中，對 DNA 的品質和純淨度要求嚴格。 MACHEREY NAGEL 的 NucleoMag® Tissue 試劑盒提供了基於磁珠的快速基因組 DNA 純化解決方案。此試劑盒設計精簡，適用於 96 孔板模式，可為 PCR、NGS 或其他酵素反應提供高品質、高純度的 DNA 模板。 結合 Opentrons Flex™ 核酸萃取工作站，可高效純化 HeLa 細胞基因組DNA。工作站配備Opentrons Flex™ 環形磁力架、加熱振盪模組，以及5-1000 µL 單通道和8 通道移液器，還可選擇96 通道移液器，適用於各種樣本類型提取DNA，包括其他真核細胞或組織。 Opentrons Protocol Library 中提供了結合 Opentrons Flex™ 核酸萃取工作站與 NucleoMag® Tissue 試劑盒使用的協議，可直接下載使用。

應用說明 NucleoMag® 組織與 Opentrons Flex™

NucleoMag® Tissue 試劑盒的原理是基於核酸在特定結合條件下可逆吸附到 NucleoMag®B-beads 上。在處理高達 20 mg 的組織樣本或 1×10^6 個 細胞時，先加入蛋白酶 K 和裂解緩衝液T1，然後透過加入緩衝液 MB2 促進核酸與磁珠的可逆結合。隨後，在磁珠吸附後，使用洗滌緩衝液 MB3 和 MB4 進行洗滌，以去除鹽和其他雜質。接著進行乾燥步驟或進行 MB5 洗滌，最後使用洗脫緩衝液 MB6 將 DNA 洗脫下來。所有的移液和磁珠純化步驟都由 Opentrons Flex™ 完成。

應用資料

從HeLa細胞中萃取DNA

利用 Opentrons Flex™ 工作站搭配 NucleoMag® Tissue 試劑盒，成功從2.4×10^5 個 HeLa 細胞中萃取了高純度 DNA。透過使 TapeStation 對純化後的 DNA 進行評估，包括評估 DNA 完整性（DIN）和片段大小分佈（虛擬凝膠成像），結果顯示 DNA 的平均 DIN 值為9.0±0.09。這表明 Opentrons Flex™ 工作站與 NucleoMag® Tissue試劑盒結合使用，能夠穩定地從 HeLa 細胞中提取高品質的 DNA 。

值得信賴的 qPCR 檢測結果

透過進行 qPCR 分析（以藍色條表示），使用 PowerTrackTM SYBR GreenMaster Mix 作為試劑，引子經 IDT 設計，靶向基因組中 β-2- 微球蛋白的一個 190 bp 區域。 qPCR 結果顯示，在所有測試樣本中都能穩定檢測到擴增片段，顯示這個自動化核酸純化流程適用於各種常見的基於酵素的下游應用。這些結果證明了 Opentrons Flex™ 工作站搭配 NucleoMag® Tissue 試劑盒萃取的 DNA 在 qPCR 檢測中表現出可靠性。

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