Opentrons Flex 自動化移液工作站24 小時全程自動化輕鬆製備高達 384 個質粒文庫

簡介高通量基因組分析是生命科學研究中不可或缺的重要工具，這項技術在推動科研進步方面發揮著至關重要的作用。為了滿足了科學研究領域對高效、準確製備方法的迫切需求，seqWell 的 Express Plex™Library Kit 提供了一種專門用於高通量製備質粒和擴增子文庫的解決方案。在傳統的手工製備文庫方法中，完成 96 個樣品的製備需要花費長達 90 分鐘的時間，其中手動操作時間佔據了 30 分鐘。這種方式不僅效率低下，還容易因為人為因素而引入誤差。為了改善此一狀況，本文比較了兩種文庫製備方法，一種是在 Opentrons Flex™ 移液工作站上使用seqWell ExpressPlex™ Library Kit ，另一種是手工製備文庫。透過結合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex™ Library Kit，我們可以大幅縮短文庫製備時間，提高樣本通量。這種自動化的解決方案不僅提升了製備效率，也降低了人為誤差的風險，為生命科學研究提供了更可靠、更有效率的工具。 材質與方法ExpressPlex 工作流程:根據 Express Plex 的工作流程，我們在 Flex 自動化移液工作站上進行文庫製備。實驗過程中，我們輸入16 ng 的 pUC19 ，再將所有組分加入反應板 ， 用 3000 rpm 的轉速混勻 90 秒，然後進行後續的文庫製備和混合步驟。最終的文庫在 NextSeq 2000 定序儀上進行 2X150 bp 定序。

圖1.A ) Express Plex 工作流程包括將index 和DNA 加入反應板（已含有酵素等混合物），然後進行擴增、混合和MAGwise 磁珠純化；B ) Flex 工作站包括吸頭盒、模組、轉板抓手和其他配件；C ) Flex 工作站板位設置，用於在擴增後將4 個反應板進行文庫混合。

結果

圖2 . A ) 結果顯示96 孔板中文庫數據變異係數( CV )為12.7%； B ) 95% 的文庫數據通過了數據預處理，為高質量數據，且超過90% 文庫質量得分達到Q30； C ) 由Flex 製備的文庫比手動製備的文庫濃度更高。

圖 3 . 利用錯開的開始時間，可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時內製備 8 個獨立的 96 混 1 文庫。在 Flex 上設定第一塊反應板後，可以在 24 小時內完成 768 個文庫的製備。

結論在 Flex 移液平台上製備的 96 個 pUC19 質粒樣本文庫呈現出了高度均一的質量，充分證明了 Flex平台在自動化文庫製備方面的卓越性能。與手動製備相比，自動化文庫製備不僅穩定性較佳，而且文庫濃度更高。此外，超過95%的讀取成功通過定序儀質檢 PF，這進一步驗證了自動化製備流程的高效率和準確性。 Flex 移液工作站支援在單次運行中處理多達 384 個樣本，大大提高了樣本處理效率。透過合理安排時間，我們甚至可以在 24 小時內處理高達 768 個樣本，從而滿足大規模高通量基因組分析的需求。在 Flex 平台上自動化 ExpressPlex™ Library Prep Kit 工作流程，我們實現了從提取的質粒/擴增子 DNA 到資料生成的全流程自動化。這個解決方案不僅簡化了操作步驟，降低了人為誤差，而且顯著提高了實驗效率和數據質量，為生命科學研究領域的發展注入了新的動力。