客戶案例 | Zymo Research 使用OT-2進行新冠病毒檢測

Zymo Research為從事新冠病毒檢測的研究人員提供生物醫學工具和服務，包括為Opentrons客戶提供支援。

Zymo Research 是一家為研究人員提供生物醫學工具和服務的企業。目前，他們正在幫助各大實驗室進行新冠病毒檢測。為此他們創建了一個從樣本收集、RNA 提取到基於rRT-PCR檢測的完整的新冠病毒檢測工作流程，該工作流程已經進入FDA的緊急使用授權前審查狀態。 Zymo Research 作為Opentrons 的共同開發測試系統合作夥伴，Zymo Research 願意為任何有興趣將該工作流程加載到Opentrons 液體處理機器人上的組織提供技術支援。

今天我們邀請到 Zymo 的研究專家 Casey Cruz 為大家分享他們如何使用 OT-2 進行新冠檢測，協助對抗全球疫情。

Opentrons: 疫情爆發前，您的日常生活是怎麼樣的？

Casey Cruz: 在疫情爆發前，我們最初購買OT-2 是為了做RNA-Seq 文庫製備的，後期假如我們的工作不再需要用於新冠檢測，我們仍然非常期待與Opentrons合作開展這個計畫。為此，我們甚至編寫了一個用於rRT-PCR 設定的腳本，並希望將其應用於Pangea 實驗室的SARA-CoV-2 實驗室開發的測試（LDT）。身為RiboFree RNA-Seq試劑盒的產品經理，我被OT-2的價格和Opentrons 的開源社群所吸引。在專案初步驗證期它的各方面表現都很棒，但由於疫情爆發，我不得不暫時改變研究方向，轉而投入協助新冠病毒檢測專案。

Opentrons: 您現在所做的工作與您的日常工作內容有什麼不同嗎？

Casey: 我們現在的工作是提交關於新冠病毒檢測工作流程的 FDA 緊急使用授權申請。這個計畫工作流程包含從樣本採集到RNA 萃取再到rRT-PCR 檢測，從運輸介質DNA/RNA 保護劑開始，在樣本收集和運送過程中需要把新冠病毒完全滅活，這樣就可以確保RNA 在室溫下能夠最高保存30天。這是在實際應用中一個很好的方法，使生物樣本中的 DNA/RNA 可以在沒有冷鏈的情況下保存，當樣本被運回實驗室就可以用於自動化樣本處理工作流程。

接下來，我們使用Quick-DNA/RNA Viral MagBead Kit 試劑盒進行RNA 萃取，並使用Quick-SARS-CoV-2 rRT-PCR Test Kit 試劑盒完成新冠病毒檢測的工作流程。

Pangea 實驗室是一家獲得CLIA 認證和CAP 認證的臨床測試實驗室，這裡的SARA-CoV-2 實驗室開發測試(LDT) 是從收到樣本開始，然後他們使用KingFisher 提取RNA，使用Quick-SARS- CoV-2 rRT-PCR 試劑盒檢測新冠病毒。此工作流程使用的試劑是 Zymo Research 目前正在等待美國食藥監局（FDA）緊急使用授權（EUA）的試劑。讓這個系統啟動並運行，並為申請緊急使用授權（EUA）進行驗證實驗，是 Pangea 團隊目前正在做的主要工作。

Opentrons: 新冠病毒檢測專案中，最讓您感到興奮的是什麼？

Casey: 最讓我興奮的是，這個計畫在這個關鍵時刻正在幫助有需要的人。很多時候，當你做研究時，你會感覺與結果相去甚遠，但這次不同。透過這個新冠檢測工作流程，我能明顯地感受到我們的技術正在幫助醫療專業人員並幫助阻止疾病的傳播，這將關係到許多人的生命健康。我很感激能夠為此做出貢獻，這對世界將產生持久的影響並真正發揮作用。

Opentrons: 關於這個項目，您認為關鍵要點是什麼？

Casey: 我認為關鍵在於確保安全運輸臨床樣本。 DNA/RNA 保護劑可確保病毒滅活，從而確保進行診斷測試的人員安全；檢測人員需要做的就是對試管外部進行去污處理，確保樣本就可以安全使用。我們非常重視確保從樣本採集開始的診斷全過程安全性和準確性。

如果您想在自己的實驗室中部署同款 Opentrons 系統，請聯絡 covid-19@opentrons.com。