Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能

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DNA稀釋

一種降低DNA濃度的方法，以更好地適應各種生物學程序，如聚合酶鏈反應(PCR)、DNA定序、分子克隆和即時聚合酶鏈反應(qPCR)。

稀釋 DNA 通常是透過標準稀釋、系列稀釋或使用分光光度計進行的，對精度和準確性要求很高，人工移液面臨的挑戰包括不準確、DNA 降解和交叉污染。透過液體處理系統實現自動化可提高準確性、可重複性、效率和吞吐量，同時降低污染風險，進而改善流程。

稀釋 DNA 的工作流程

各種工作流程都需要稀釋 DNA，例如：

  1. 聚合酶鍊式反應 (PCR):PCR 需要特定濃度的 DNA 作為起始材料
  2. DNA 定序:Sanger 和下一代定序(NGS) 都需要特定的 DNA 濃度
  3. 分子克隆:DNA稀釋對於優化連接反應是必要的
  4. 定量 PCR (qPCR):與 PCR 類似，qPCR 需要最佳 DNA 濃度才能進行準確定量。

DNA 稀释从未如此简单

OT-2 是一款台式液体处理器，其设计足够方便且灵活，可以自动化许多常见的应用。

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稀釋 DNA 的最佳方法1.  標準稀釋: 將特定體積的 DNA 加入緩衝溶液中以降低濃度。
2. 連續稀釋: 在此過程中，先進行初始稀釋，然後逐步進行進一步稀釋。這允許使用一系列濃度來優化實驗條件。3.  使用分光光度計稀釋：使用分光光度計測量DNA濃度，然後使用緩衝溶液將DNA稀釋至所需濃度。

協議聚焦

Opentrons 可協助您使用 OT-2和 Opentrons Flex 的開源協議自動進行 DNA 稀釋

為何稀釋 DNA 如此困難？

由於需要精確度和準確度，稀釋 DNA 可能具有挑戰性。測量中的小錯誤可能會導致最終 DNA 濃度的顯著差異，從而影響下游應用。此外，DNA 容易降解和污染，這可能發生在稀釋過程中。

使用手動移液稀釋 DNA 的主要挑戰

  1. 不準確與不精確:移液時的細微差別可能會導致 DNA 濃度出現重大差異。
  2. DNA 降解:如果處理不當，DNA 可能會在過程中降解。
  3. 交叉污染:如果移液管沒有正確清潔，則有交叉污染的風險。

自動化 DNA 稀釋過程

自動化液體處理系統可用於自動化 DNA 稀釋過程。這些機器可以準確分配精確量的 DNA 和稀釋劑，從而降低人為錯誤的風,險並提高可重複性。自動化方案可以輕鬆調整以創建一系列 DNA 濃度。

自動化比手動移液稀釋 DNA 的優勢

  1. 提高精確度和準確性： 與手動移液相比，自動化系統能更精確地處理極小體積和高濃度的 DNA。
  2. 時間效率高： 自動化系統可同時稀釋多個樣本，大幅減少了稀釋過程所花費的時間。
  3. 降低污染風險：自動化系統可將交叉污染和 DNA 降解的風險降至最低。

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