Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能

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DNA 濃度均一化

分子生物學和蛋白質體學中的一項重要實驗室規程,用於確保不同樣本中成分(如 DNA、RNA 或蛋白質)濃度的一致性。它能提高下游分析(如定序、PCR 或蛋白質檢測)的準確性和可靠性。

DNA 濃度均一化通常用於次世代定序(NGS)、聚合酶鏈反應(PCR)和蛋白質體學等工作流程。儘管 DNA 濃度均一化非常重要,但由於需要精確測量和計算,尤其是在使用手動移液的情況下,因此難度很高且容易出錯。

手動濃度均一化、使用液體處理系統進行濃度均一化和使用微孔板閱讀器進行濃度均一化是這一過程中採用的一些方法。然而,自動化系統因其更高的準確性、可重複性和效化率,以及更低的污染風險而越來越受到青睞。

需要 DNA 濃度均一化的工作流程

此技術常用於各種分子生物學工作流程,包括:

  1. 下一代定序 (NGS): 在 NGS 中,濃度均一化對於確保每個樣本對定序運行的貢獻相同至關重要。
  2. 聚合酶連鎖反應 (PCR): 在進行 PCR 之前,通常要對 DNA 樣本進行濃度均一化處理,以確保所有樣本的擴增效果相同。
  3. 蛋白質體學: 對於蛋白質檢測,所有樣本的蛋白質濃度必須相等,以確保準確的比較和分析。

DNA 浓度均一化从未如此简单

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執行濃度均一化的主要方法1.  手動濃度均一化:這包括使用分光光度計或螢光計測量每個樣本中 DNA、RNA 或蛋白質的濃度,然後手動稀釋或濃縮每個樣本以達到所需的濃度。
2.  使用液體處理系統進行濃度均一化:此自動化方法使用液體處理系統來測量和調整每個樣本的濃度。與手動濃度均一化相比,這種方法通常更加精確,不易出錯。3.  使用微孔板閱讀器進行濃度均一化:此方法是使用微孔板閱讀器測量多孔板中每個樣本的濃度,然後使用液體處理系統調整濃度。

協議聚焦

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DNA 濃度均一化為何如此困難?

DNA 濃度均一化之所以困難,是因為它需要精確的測量和計算。即使是很小的誤差也會嚴重影響最終結果。此外,它還耗時費力,尤其是在處理大量樣本時。

手動移液進行濃度均一化的主要挑戰

手動移液面臨多項挑戰,包括:

  1. 人為錯誤:手動移液容易出現人為錯誤,導致最終濃度均一化不準確。
  2. 可重複性:由於不同實驗室人員的技術略有差異,透過手動移除液體很難獲得一致的結果。
  3. 效率:手動移液非常耗時,尤其是在處理大量樣本時。

如何使 DNA 濃度均一化過程自動化

濃度均一化過程可透過液體處理系統自動化。這些系統可以使用分光光度法或螢光測定法測量每個樣品的濃度,計算所需的調整量,然後準確分配適量的稀釋液或濃縮樣品,以達到所需的濃度。

DNA 濃度均一化過程自動化比手動移液的優勢

與手動移液相比,濃度均一化製程的自動化具有以下優點:

  1. 準確性: 與手動移液相比,自動化系統通常更精確,不易出錯。
  2. 可重複性: 由於製程是自動化的,因此每次都能以完全相同的方式重現,從而獲得更一致的結果。
  3. 效率: 自動化系統可同時處理多個樣本,大幅減少了 DNA 濃度均一化所需的時間。
  4. 降低污染風險: 自動化系統最大程度地減少了人機互動的需要,從而降低了樣本污染的風險。

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