Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能

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分析樣本製備

這是一個關鍵過程,將樣本轉化為適合分析程序(如PCR、NGS和細胞實驗)的格式。

分析樣本準備可能包括萃取/純化、濃縮/稀釋或修改,這取決於分析的要求。儘管其重要性不言而喻,但它帶來了許多挑戰,例如保持重複性、避免污染以及管理勞動密集型工作流程——尤其是手動操作時。自動化系統可以解決這些問題,提供更高的準確性、增強的重複性、節省時間和勞動,並降低污染風險。

手動標準化、使用液體處理系統的標準化和使用微孔板讀數器的標準化是執行此過程的一些方法。然而,自動化系統因其更高的準確性、重複性和效率以及降低的污染風險而越來越受到青睞。



分析樣本製備的工作流程

分析樣本製備是分子生物學和蛋白質體學等許多工作流程的基礎:

  1. PCR和qPCR:在這些過程中,樣本準備包括DNA或RNA的萃取和純化。
  2. 下一代定序(NGS):在NGS工作流程中,樣本準備涉及步驟如DNA片段化、接頭連接和擴增。
  3. 蛋白質分析:對於像ELISA或Western blot這樣的蛋白質分析,樣本準備可能包括蛋白質萃取、定量和可能的變性處理。
  4. 細胞實驗:在這些實驗中,樣本準備可能包括培養細胞、用特定化合物處理細胞,然後可能需要裂解細胞以釋放其內容物。

分析样本制备从未如此简单

OT-2 是一款台面式液体工作站,设计方便灵活,可自动处理许多常见应用。

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分析樣本製備的最佳方法

  1. 萃取/純化:這可能涉及像苯酚-氯仿萃取這樣的DNA或RNA萃取過程,或用於蛋白質純化的各種色譜技術。
  2. 濃縮/稀釋:樣本可能需要使用離心過濾器等方法進行濃縮,或稀釋至適合分析的濃度。
  3. 修改:有些分析需要在分析前對樣本進行化學或酵素學修改。例如,蛋白質可能需要在運行SDS-PAGE之前進行變性和還原。

協議亮點

Opentrons 可協助您使用 OT-2和 Opentrons Flex 的開源協定自動進行分析樣本製備

為什麼分析樣本製備如此閒難?

分析樣本製備通常被認為是實驗過程最具挑戰性的部分。它需要高度的精確性和準確性,以確保結果的重複性。在這個階段,樣本最容易受到污染或降解,這可能導致結果不準確。此外,最佳的樣本準備協議可能會因樣本類型和特定分析的不同而有很大差異。

使用手動移液進行分析樣本製備的關鍵挑戰

  1. 重複性:即使是移液技術中的微小變化也可能導致結果的顯著差異。
  2. 污染:在準備過程中,樣本容易受到污染,特別是在手動移液時。
  3. 時間和勞動密集:手動準備樣本進行分析可能非常耗時且勞力密集,尤其是當處理大量樣本時。

分析樣本的自動化製備

分析樣本製備的自動化可以透過機器人液體處理系統來實現。這些系統可以準確地分配精確體積,混合試劑,甚至執行加熱或冷卻等操作。使用這些系統可以減少人為錯誤,提高重複性,並顯著加快樣本準備過程。

與手動相比,自動化製備分析樣本的優勢

  1. 提高重複性:自動化系統確保樣本處理條件的一致性,進而提高實驗之間的重複性。
  2. 節省時間和勞動:自動化系統能夠同時處理多個樣本,大幅減少所需的時間和勞動。
  3. 降低污染風險:自動化系統減少了人工處理的數量,從而降低了污染的風險。

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歡迎聯絡我們,我們的專業應用科學家團隊將協助您確認自動化實驗流程是否與您的需求適配。如果您有查看實驗流程運作的需求,可與我們預約線上Demo,與專家團隊深入討論您的實驗需求。

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