Opentrons 客戶訪談 | 謝菲爾德大學的 Oscar Swindley

Oscar Swindley 在謝菲爾德大學從事單株抗體折疊和組裝工作。他使用 Opentrons OT-2 移液機器人對細胞培養物進行滴度測定。

謝菲爾德大學是英國極具影響力的研究型大學之一，建校歷史悠久，在2022 QS 世界大學排名第95 名。 Oscar Swindley 是雪菲爾大學化學與生物工程系博士，從事單株抗體折疊和組裝工作。他使用Opentrons OT-2 移液機器人進行滴度測定以進行細胞培養開發。今天他將為大家分享他對 OT-2 的使用體驗。

Oscar Swindley 是雪菲爾大學化學與生物工程系的博士生，合成生物學平台開發團隊的一員。該實驗室於2019年8月購買了首台 Opentrons OT-2，用於細胞培養開發的滴度測定自動化，Oscar 是負責操作OT-2 的深度使用者。

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景？

Oscar Swindley: 我從事的研究方向是單株抗體折疊和組裝過程的遺傳及化學操作，以及自動化程序的最佳化和整合。我們使用 OT-2 在我們的實驗室中執行大量的細胞培養操作。我剛剛完成了我們的第一個大型篩選項目，其中所有細胞培養，轉染，樣品收集和滴度測定都在 OT-2 上進行。

Opentrons: 如何形容您在實驗室的一天？

OS: 最近我正在處理在 OT-2 上完成的第一次大規模細胞培養篩選的結果。我一直在使用 OT-2 進行滴度測定。 OT-2 支援並簡化了整個流程。除此之外，我的常規日常工作包括在搖瓶和孔板上進行常規的細胞培養，以及在分子生物學實驗室進行其他實驗。

Opentrons: 為什麼選擇 OT-2？

OS: 在我們的實驗室引入 OT-2 的目的是提高我們平台的可重複性。我們在實驗室使用 24 孔和 96 孔板進行高通量篩選。我們面臨的主要困難是轉染，因為當我們以非常高的密度重新懸浮細胞時，溶液會變得黏稠，細胞會迅速沉降。我們需要準確地把樣本分配到整個孔板上，以便在每個孔中種植相同數量的細胞。這是一個大量重複的過程，且處理的液體體積非常小。我們面臨的最大問題是如何在細胞隨著時間推移逐漸沉降的情況下，始終保持液體充分混合並成功種植細胞。

Opentrons: 您具體使用 OT-2 做什麼，它如何適應您的工作流程？

OS: 我們使用 OT-2 來設定和運行我們的96孔電轉染平台，從多種培養板格式取樣，並執行板基測定。特別是對於我們的電轉染平台，OT-2 將 DNA、緩衝液和細胞結合在一起，然後將混合物分配到電轉染板中。轉染後，OT-2 進行稀釋、混合和為細胞提供養分，然後將其種入 24 孔培養板中。 3 天後我們將用機器人對培養物進行測定。這包括混合和從培養板取樣進行各種下游測定。最後，OT-2 能夠將樣本加載到玻璃片上，用於我們的高通量細胞計數器，並收穫上清液進行滴度分析。在最近的一組篩選實驗中，OT-2 幫助我們進行了 22 個電轉染板和相關的取樣。 OT-2 只需 20 分鐘就能執行一次滴度分析，這太棒了。我可以全天讓機器人持續運作。

Opentrons: 用你們的 OT-2 開始實驗是什麼感覺？

OS: 我寫第一個協議腳本大約花了 2 個月的時間。但是腳本一旦完成，所有的資訊都在腳本裡，我就可以快速地繼續進行更複雜的實驗。我把我的所有腳本都上傳到了我的GitHub 頁面上，如果有興趣的話，大家都可以去看看。

Opentrons: 在使用 OT-2 之前，您是否使用過其他實驗室自動化設備？

OS: 沒有。我以前使用過 BioMek，並設定了 SOP。為了更好地對 OT-2 進行編程，我在 8 月至 11 月期間學習了 Python。

Opentrons: 您還有其他關於 OT-2 的體會要跟大家分享的嗎？

OS: 整體來說這是一台好設備，但它沒有安全保障裝置，也就是說，它無法辨識障礙物，也無法意識到吸頭是否掉落。我們現在遇到的問題是如能能夠在故障發生時追蹤。另一個困難是設備與 24 孔板的兼容性不強，因此我不得不想辦法騙過它，方法是每隔一行取出吸頭。但是如果你知道如何編程控制機器人，你總是可以找到解決方案的。總的來說，我認為它非常適合用於研究，在你的每次實驗中你可以根據你的需求調整實驗方案。