Flex应用专题 | 解锁蛋白质谱前处理自动化的无限潜能
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核酸分離是分子生物學的基石技術。許多實驗室為此使用手動純化方案,但它們有四個缺點。核酸分離是分子生物學的基石技術,為大多數濕實驗室應用提供起始材料。然而,分離材料只是成功的一半。分離核酸的純化對於可靠且一致的數據以及整體實驗成功同樣重要。例如:
去除可能幹擾下游反應的抑制劑和雜質,例如 PCR 和逆轉錄酶抑制劑。抑制劑和雜質可能來自樣品本身(例如,在複雜的環境樣品的情況下)、分離過程中使用的化學物質(例如,洗滌劑、有機溶劑)和/或工作區域中的污染。純淨的起始材料對於 NGS 樣品製備至關重要。在標靶富集、文庫建構和尺寸選擇過程中存在的任何雜質或不需要的材料(例如,引子二聚體)都可能導致偽影,使定序資料變得毫無意義,可能導致大量時間和金錢的損失。
從反應混合物和瓊脂糖凝膠中純化所需的PCR 擴增子、質粒、限制性消化的DNA 片段和RNA(例如小RNA 物種)是各種應用的先決條件技術,包括克隆、基因改造、RNA和DNA 表徵、體外轉錄和翻譯等。手動純化方案有其缺點如今,分子生物學家有多種易於使用的試劑盒可供選擇,這些試劑盒可以從幾乎任何可以想像到的樣品類型中進行無縫核酸分離和純化。然而,雖然這些試劑盒中的許多在純化核酸方面非常有效,但它們通常是為手動操作而設計的,這帶來了幾個問題:
污染風險。與所有涉及移液的手動工作流程一樣,手動純化有樣品間交叉污染的風險。使用多通道移液可以降低此風險,但此選項僅適用於基於板的方案。即使使用多通道移液,有時也難免出錯,尤其是在處理多個輪次的相對大量樣本時可能產生的疲勞。難以擴大規模。對於試管格式的方案,工作人員通常受到一次在離心機和其他必要設備中可以處理的試管數量的限制。常見的解決方法是分批處理大量樣本,但這種方法速度慢,需要大量的動手工作。因此,手動淨化對於大規模操作來說不是可行的選擇。容易出錯。除了樣本殘留的風險外,手動方案還有其他錯誤風險。想像一下這樣一個場景:您已經標記了 24 個樣本管,但在對工作台進行消毒時,方案進行到一半時標籤被洗掉了。在試圖將污染風險保持在低水平時,這是一個很容易陷入的陷阱,但很難從中恢復過來。這種情況可能會毀掉整個實驗。耗時。短暫的孵育步驟和短暫的離心旋轉使得每次運行的可操作時間非常短,而批量處理樣品的需求將佔用您更多的寶貴時間。如果純化是實驗室工作流程的常規部分,它可以幫助您的實驗室成員更好地利用他們的時間。自動化消除手動製程錯誤並提高速度和生產力上述問題可能會單獨或組合影響資料品質和實驗輸出。如果您正在研究核酸,您已經知道純化的重要性。選擇自動化設定將允許您解決與手動協議相關的問題,幫助您獲得一致的數據,最大限度地減少錯誤,提高速度和吞吐量,並讓您有更多的可操作時間花在其他更令人興奮的實驗室任務上!從長遠來看,您的實驗室甚至可以透過投資自動化來節省金錢。
那你還在等什麼?有了移液機器人和正確的方案,您可以期待實現以下程序的自動化:
PCR 產物純化質粒純化酵素和標記反應後的 DNA 和 RNA 清理NGS 文庫清理PCR 抑制劑去除還有更多!入門正如我們上面提到的,當您擁有一個觸手可及的機器人時,一切皆有可能。大多數純化程序都可以適應自動化。您需要做的就是弄清楚方案,但您不需要獨自完成這項工作。如果您正在考慮為您的實驗室實現自動化,請與我們聯絡。我們很樂意幫助您完成它。
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