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使用 Opentrons Flex™ 核酸提取工作站纯化从细胞或组织样本提取基因组 DNA

应用优势

使用 Opentrons Flex™ 搭配NucleoMag® Tissue 试剂盒,进行纯化核酸的优势:

1.方法经过验证,确保全自动提取纯化过程准确性。
2.产量和纯度重复性好,稳定回收基因组 DNA。
3.处理能力强,可最多同时处理 96个样品。
4.可访问 Opentrons 协议库或通过MACHEREY NAGEL 的自动化技术支持automation-bio@mn-net.com获取更多详细信息。

导言

提取基因组 DNA 是生命科学和应用测试实验室中常见的实验流程,尤其在基因分型测试、测序和临床研究等下游应用中,对 DNA 的质量和纯净度要求严格。
MACHEREY NAGEL 的 NucleoMag® Tissue 试剂盒提供了基于磁珠的快速基因组 DNA 纯化解决方案。该试剂盒设计精简,适用于 96 孔板模式,可为 PCR、NGS 或其他酶反应提供高质量、高纯净度的 DNA 模板。
结合 Opentrons Flex™ 核酸提取工作站,可高效纯化 HeLa 细胞基因组DNA。该工作站配备Opentrons Flex™ 环形磁力架、加热振荡模块,以及5-1000 µL 单通道和 8 通道移液器,还可选择 96 通道移液器,适用于各种样本类型提取 DNA,包括其他真核细胞或组织。
Opentrons Protocol Library 中提供了结合 Opentrons Flex™ 核酸提取工作站与 NucleoMag® Tissue 试剂盒使用的协议,可直接下载使用。

NucleoMag® Tissue 试剂盒的原理是基于核酸在特定结合条件下可逆吸附到 NucleoMag®B-beads 上。在处理高达 20 mg 的组织样本或 1×10^6 个 细胞时,首先加入蛋白酶 K 和裂解缓冲液T1,然后通过加入缓冲液 MB2 促进核酸与磁珠的可逆结合。随后,在磁珠吸附后,使用洗涤缓冲液 MB3 和 MB4 进行洗涤,以去除盐和其他杂质。接着进行干燥步骤或进行 MB5 洗涤,最后使用洗脱缓冲液 MB6 将 DNA 洗脱下来。所有的移液和磁珠纯化步骤都由 Opentrons Flex™ 完成。

应用数据

应用数据

从HeLa细胞中提取DNA

利用 Opentrons Flex™ 工作站搭配 NucleoMag® Tissue 试剂盒,成功从2.4×10^5 个 HeLa 细胞中提取了高纯度 DNA。通过使 TapeStation 对纯化后的 DNA 进行评估,包括评估 DNA 完整性(DIN)和片段大小分布(虚拟凝胶成像),结果显示 DNA 的平均 DIN 值为9.0±0.09。这表明 Opentrons Flex™ 工作站与 NucleoMag® Tissue试剂盒结合使用,能够稳定地从 HeLa 细胞中提取高质量的 DNA 。

值得信赖的 qPCR 检测结果

通过进行 qPCR 分析(用蓝色条表示),使用 PowerTrackTM SYBR GreenMaster Mix 作为试剂,引物经 IDT 设计,靶向基因组中 β-2- 微球蛋白的一个 190 bp 区域。qPCR 结果显示,在所有测试样本中都能稳定检测到扩增片段,表明这个自动化核酸纯化流程适用于各种常见的基于酶的下游应用。这些结果证明了 Opentrons Flex™ 工作站搭配 NucleoMag® Tissue 试剂盒提取的 DNA 在 qPCR 检测中表现出可靠性。

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