유전자 시퀀싱 전처리 공정

현대 생물학적 연구의 초석으로서, 유전자 시퀀싱은 전처리 과정의 미세 및 사양에 직접적으로 의존한다. 이 과정은 삶의 신비를 잠금 해제하는 열쇠 일뿐 만 아니라 과학 연구 데이터의 신뢰성을 보장하기위한 중요한 보장이기도합니다. 광대 한 유전자 시퀀싱 세계로 들어가기 전에 신중하게 설계된 전처리 단계는 필수 불가결 한 출발점입니다.

1. 유전자 시퀀싱의 사전 처리 1. DNA 추출의 목적 : DNA는 생화학 적 방법을 통해 세포, 조직 또는 혈액과 같은 샘플로부터 분리되고 정제된다. 방법 : 일반적인 추출 방법은 페놀 클로로포름 추출 방법, 실리콘 필름 흡착 방법, 자기 비드 방법 등을 포함합니다. 이러한 방법은 샘플의 단백질, 지질 및 기타 불순물과 같은 불순물을 효과적으로 제거하고 고품질 DNA를 유지할 수 있습니다. 2. DNA 정제의 목적 : 시퀀싱의 정확성을 향상시키기 위해 잔류 효소, 프라이머, DNTP 등과 같은 DNA의 불순물을 추가로 제거합니다. 방법 : 이온 교환 크로마토 그래피, 겔 전기 영동 정제 등과 같은 다양한 정제 방법이 있습니다. 이들 방법은 DNA로부터 비특이적 증폭 생성물 및 프라이머를 효과적으로 제거하여 시퀀싱 템플릿의 순도를 보장 할 수있다. 3. DNA 단편화의 목적 : 온전한 DNA 분자는 매우 길고 직접 시퀀싱에 편리하지 않기 때문에 작은 단편으로 중단되어야합니다. 방법 : 일반적으로 사용되는 단편화 방법에는 물리적 방법 (초음파 분쇄, 분무 건조 등) 및 화학적 방법 (예 : 효소 절단)이 포함됩니다. 이러한 방법은 시퀀싱에 적합한 DNA를 길이로, 일반적으로 수백에서 수천 개의 염기 쌍으로 끊을 수 있습니다. 4. DNA 라이브러리 구성의 목적 : 조각난 DNA는 서열 분석에 적합한 라이브러리를 구축하기 위해 말단 수리, A- 테일, 결찰 링커 등을 적용합니다. 방법 : 종료 수리 : DNA 조각의 끝은 최종 수리 효소를 사용하여 수리하여 적절한 끈적 끈적한 끝을 제공합니다. 꼬리 추가 : DNA 조각의 3 '끝에베이스를 추가하여 T베이스와 링커에 연결하십시오. 연결 링커 : 특정 시퀀스로 링커를 DNA 단편의 양쪽 끝에 연결하여 시퀀싱 라이브러리를 형성합니다. 5. 라이브러리 품질 관리 목적 : 도서관의 품질이 시퀀싱 요구 사항을 충족하는지 확인하기 위해 건설 된 라이브러리의 품질 관리를 수행하십시오. 방법 : 라이브러리의 품질이 시퀀싱 플랫폼의 요구 사항을 충족하도록하기 위해 전기 영동, 형광 정량화 등에 의해 라이브러리의 크기와 농도가 감지됩니다.

2. 사전 유전자 시퀀싱 처리에 Opentrons의 기기의 적용 1. OT-2 피펫 팅 로봇 (1)의 기능적 특징 : OT-2 피펫 팅 로봇은 높은 정밀도, 높은 처리량, 고가의 성능 및 고도로 사용자 정의 된 이점을 가지고 있으며, 1 μL에서 1000 μL 범위로 완료 할 수 있습니다. 단일 채널 피펫, 8 채널 피펫, 온도 제어 모듈, 열 순환 모듈, 자기 모듈 및 HEPA 모듈 등과 같은 다양한 모듈과 함께 사용할 수 있으므로 더 많은 실험 기능을 확장 할 수 있습니다. (2) 적용 시나리오 : OT-2는 핵산 정제, 단백질 제조, NGS 라이브러리 제조, PCR 증폭, 게놈 시퀀싱 및 기타 산업과 같은 다양한 생물학적 과학적 연구 시나리오에 적합하며 분자 생물 진단, 생명 공학, 의료, 식품, 진료 식별, 단백질 공학 및 기타 산업에 널리 사용됩니다. 2. Flex Full Automatic Pypetting Workstation (1) 기술 혁신 : Flex Full Automatic Pypetting Workstation은 Opentrons가 개발 한 새로운 제품으로 인텔리전스 통합, 완전 자동 및 오픈 소스 생태학을 통합합니다. 매우 유연하고 개방적이며 각 실험실의 작업 환경에 쉽게 통합 할 수 있도록 로봇 암 또는 기타 외부 장치와 통합 할 수 있습니다. 동시에 Flex는 Python API를위한 오픈 소스 인터페이스를 제공하며, 여기서 사용자는 실험 요구에 따라 독점 응용 프로그램을 설계 할 수 있습니다. (2) 모듈 공동 작업 : Flex Automated Pypetting 플랫폼에는 Flex 피펫 및 해당 소모품뿐만 아니라 열 순환 모듈, 온도 모듈, 열 진동 모듈 및 링 자기 랙과 같은 다양한 모듈이 장착되어 있습니다. 이들 모듈은 협업에서 작동하여 샘플 처리 플럭스가 최대 96의 유전자 시퀀싱 프리 프로세싱의 효율을 크게 향상시킨다.

유전자 시퀀싱의 복잡하고 정교한 과학적 연구 과정에서, 전처리 과정은 의심 할 여지없이 중요한 역할을한다. 후속 시퀀싱 데이터의 정확성과 신뢰성을 결정할뿐만 아니라 전체 연구 프로젝트의 효율성과 성공 또는 실패에 직접적인 영향을 미칩니다. Opentrons 및 지원 기술과 같은 고급 자동화 된 피펫 팅 워크 스테이션을 채택함으로써 다양한 실험 요구의 변화에 ​​쉽게 적응하여 과학 연구원에게 큰 편의를 제공 할 수 있습니다.

관련 읽기 권장 사항

Ashg 2023 에서 Opentrons를 만나십시오

opentrons 프로토콜 디자이너 업데이트 : 배치 편집 개요

피펫 백서 : 온도 제어 모듈

자동 NGS 라이브러리 준비 전자 책

PCR 반응 액체의 조성 및 처리

피펫 피펫 워크 스테이션에서 피펫의 역할