2 세대 시퀀싱과 3 세대 시퀀싱의 차이

2 세대 시퀀싱 및 3 세대 시퀀싱은 현재 게놈 연구에서 두 가지 일반적인 시퀀싱 기술이며, 원칙, 성능 및 응용 분야에는 상당한 차이가 있습니다. 게놈 연구가 지속적으로 심화되면서 2 세대 시퀀싱 및 3 세대 시퀀싱의 사용 시나리오가 점점 더 광범위 해지고 있으며, 각각 고유 한 장점과 단점이 있습니다.

2 세대 시퀀싱과 3 세대 시퀀싱의 차이

1 세대 및 2 세대 시퀀싱의 개요 2 세대 시퀀싱 (고 처리량 시퀀싱 또는 차세대 시퀀싱이라고도 함)은 현재 가장 널리 사용되는 게놈 시퀀싱 기술입니다. 화학 반응 기반 기술을 사용하여 DNA를 조각화하고 병렬 시퀀싱을 통해 대규모 클론으로 증폭시켜 대규모 게놈 데이터 수집을 완료합니다. 1. 2 세대 시퀀싱의 장점은 다음과 같습니다. (1) 높은 처리량 : 동시에 수백만 또는 수십억의 DNA 단편을 시퀀싱 할 수 있으며, 이는 매우 효율적입니다. (2) 저렴한 비용 : 상대적으로 성숙한 기술로 인해 시장에서 2 세대 시퀀싱 플랫폼의 비용이 크게 줄어들어 대부분의 과학 연구 기관 및 임상 실험실의 첫 번째 선택이되었습니다. (3) 높은 정확도 : 2 세대 시퀀싱은 특히 짧은 판독 범위 내에서 높은 정확도를 가지므로보다 정확한 게놈 데이터를 얻을 수 있습니다. 2. 2 세대 시퀀싱의 단점은 다음과 같습니다. (1) 짧은 읽기 길이 : 2 세대 시퀀싱의 읽기 길이는 일반적으로 짧아서 (일반적으로 100-300bp), 일부 복잡한 영역 (예 : 반복 서열, 구조적 변형)의 분석에 제한이 있습니다. (2) 반복 시퀀스 분석의 어려움 : 짧은 시퀀싱 단편으로 인해, 2 세대 시퀀싱은 장거리 게놈 구조를 다루기가 어렵고 복잡한 게놈 구조 및 큰 반복 영역을 효과적으로 재구성하는 것은 불가능합니다.

2 세대 시퀀싱의 개요 2 세대 시퀀싱과 달리 3 세대 시퀀싱 기술은 단일 분자의 직접 시퀀싱 방법이며 DNA를 조각화 할 필요가 없습니다. . 3 세대 시퀀싱의 가장 큰 특징은 "긴 읽기 및 긴 시퀀싱"이라고하는 최대 수천 또는 수만 또는 수만 개의 기본 쌍의 DNA 단편을 읽을 수 있다는 것입니다. 1. 3 세대 시퀀싱의 장점은 다음과 같습니다. (1) 긴 읽기 길이 : 3 세대 시퀀싱은 더 긴 읽기 길이 (수천에서 수만에서 수만 개의베이스에 도달 할 수 있음)를 제공하여 복잡한 게놈 구조, 반복 서열 및 기타 어려움을 더 잘 처리 할 수 ​​있습니다. (2) 단편화가 필요하지 않습니다 : 3 세대 시퀀싱은 단일 분자 실시간 시퀀싱 기술을 사용하여 단일 DNA 분자를 직접 서열하여 2 세대 시퀀싱에서 단편화 및 증폭 과정을 피할 수 있습니다. (3) 구조적 변화 분석이 달성 될 수있다 : 장기 판독 및 긴 특성으로 인해 3 세대 시퀀싱은 유전자 재 배열, 삽입 및 결실과 같은 게놈의 구조적 변화를보다 정확하게 식별하는 데 도움이 될 수있다. 2. 3 세대 시퀀싱의 단점은 다음과 같습니다. (1) 높은 비용 : 현재, 3 세대 시퀀싱의 기술 및 장비는 비교적 새롭고 비용이 높으며 시퀀싱 데이터의 출력이 비교적 제한적입니다. (2) 정확도 문제 : 3 세대 시퀀싱은 다른 시퀀싱 원칙으로 인해 긴 읽기 데이터를 얻을 수 있지만 단일 시퀀싱의 오류율은 높기 때문에 일반적으로 2 세대 시퀀싱 데이터를 결합하여 정확도를 향상시켜야합니다.

3 세. 2 세대 시퀀싱과 3 세대 시퀀싱의 주요 차이점 1. 3 세대 시퀀싱은 단일 분자 실시간 시퀀싱 기술을 사용하여 단편화없이 단일 DNA 분자의 서열을 직접 결정합니다. 2. 읽기 길이 : 2 세대 시퀀싱의 읽기 길이는 일반적으로 100-300bp 사이이며, 3 세대 시퀀싱의 읽기 길이는 수천에서 수천 개의베이스에 도달 할 수 있습니다. 긴 판독 길이는 3 세대 시퀀싱이 게놈 어셈블리 및 복잡한 영역 분석에서 명백한 장점을 갖습니다. 3. 정확도 : 2 세대 시퀀싱은 특히 짧은 판독의 경우 정확도가 높고 긴 게놈 서열이 정확하게 얻을 수 있습니다. 그러나, 단편화 특성으로 인해 반복 서열과 같은 복잡한 영역을 다루기가 어렵다. 3 세대 시퀀싱은 긴 판독의 이점을 제공 할 수 있지만 단일 시퀀싱은 높은 오류율을 가지며 일반적으로 다른 데이터와 조합 된 수정이 필요합니다. 4. 응용 시나리오 : 2 세대 시퀀싱은 일반적으로 게놈 시퀀싱, 전 사체 분석 및 소규모 게놈 분석 등에 사용되며 대규모 데이터 생성이 필요하고 읽기 길이가 낮은 시나리오에 적합합니다. 3 세대 시퀀싱은 구조적 변화 분석, 게놈 어셈블리 및 복잡한 게놈에 대한 연구에 더 많이 사용되며, 오랜 판독이 필요한 연구 요구에 특히 적합합니다.

2 세대 시퀀싱 및 3 세대 시퀀싱은 각각 게놈 연구에서 고유 한 장점과 단점이 있습니다. 2 세대 시퀀싱은 높은 처리량, 저렴한 비용 및 높은 정확도를 가진 대부분의 기존 게놈 연구에 적합합니다. 3 세대 시퀀싱은 오랫동안 읽기와 긴 특성으로 복잡한 게놈 구조, 반복 서열 및 구조적 변화 분석을 다루는 데 비교할 수없는 이점을 가지고 있습니다. 연구 요구에 따르면 올바른 시퀀싱 기술을 선택하면 유전체학의 연구 과정을보다 효율적으로 촉진 할 수 있습니다.

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