단백질 학적 시퀀싱 샘플 요구 사항은 실험, 샘플 유형 및 후속 분석 요구 사항의 목적에 따라 다릅니다. 다음은 몇 가지 일반적인 샘플 요구 사항이 있지만 실험실의 특정 프로토콜과 사용 된 기술에 따라 특정 요구 사항을 조정해야 할 수도 있습니다.
1. 샘플 품질의 단백질 학적 시퀀싱은 세포, 조직, 체액 (예 : 혈액, 소변, 뇌척수액 등), 미생물, 동물 및 식물 조직 및 환경 샘플 (토양, 물, 공기 등)을 포함하되 이에 국한되지 않는 광범위한 샘플을 가지고 있습니다. 1. 순도와 완전성 : 샘플은 불순물과 오염 물질의 간섭을 피하기 위해 가능한 한 순수해야합니다. 조직 샘플의 경우 샘플의 대표성을 보장하기 위해 혈관, 지방, 결합 조직 등과 같은 관련없는 조직을 제거해야합니다. 2. 신선도 : 단백질 분해 및 불 활성화를 방지하기 위해 신선하게 수집 된 샘플을 가능한 빨리 처리해야합니다. 즉시 처리 할 수없는 샘플의 경우 액체 질소와 같이 적절하게 저장해야합니다. 3. 반복적 인 동결-해동을 피하십시오 : 단백질 분해 및 변성을 줄이기 위해 샘플을 반복적으로 동결 시동하지 않아야합니다. 분취 량이 필요한 경우 액체 질소에서 빠르게 냉동하여 가능한 빨리 사용해야합니다.
2. 샘플 크기 샘플 크기는 실험의 목적과 샘플 유형에 따라 다릅니다. 일반적으로, 다음은 몇 가지 일반적인 샘플 크기 요구 사항입니다. 1. 세포 : 단백질 학사 프로젝트의 경우 약 1 × 107 세포가 일반적으로 필요합니다. 2. 조직 : 동물 조직 샘플은 일반적으로 약 100 mg (Proteomics Project) 또는 500 mg (인산화 된 프로테오믹스 프로젝트)의 새로운 중량이 필요합니다. 식물 조직 샘플은 200 mg (Proteomics Project) 또는 1 g (Phosphoproteomics Project)와 같은 신선한 체중이 필요합니다. 3. 신체 액 : 예를 들어 혈액, 소변 등, 실험 요구에 따라 충분한 양의 샘플을 수집해야하며 용혈 및 오염과 같은 문제를 피하기 위해주의를 기울여야합니다.
3. 샘플 가공 및 보존 1. 불순물 청소 및 제거 : 세포 및 조직 샘플의 경우, 잔류 배양 배지, 혈액 및 기타 오염 물질을 제거하기 위해 사전 냉각 된 PBS 및 기타 완충액이 필요합니다. 2. 용해 및 추출 : 적절한 용 해물 및 추출 방법을 사용하여 샘플에서 단백질을 방출합니다. 조직 샘플의 경우 균질화, 원심 분리 및 기타 단계도 필요할 수 있습니다. 3. 저장 및 운송 : 샘플은 -80 ℃ 냉장고에 저장해야합니다. 접착제 스트립, 단백질 솔루션 등과 같은 특정 특수 샘플의 경우 저장 및 운송 조건에 특별한주의를 기울여야합니다.
4. 기타 예방 조치 1. 케라틴 오염을 피하십시오 : 샘플을 처리 할 때는 장갑, 마스크 및 헤드 커버와 같은 보호 용품을 착용하여 각질과 같은 오염 물질의 오염을 피해야합니다. 2. 샘플 표시 및 기록 : 샘플 유형, 수집 시간, 처리 단계 및 후속 분석 및 추적을 포함한 샘플을 명확하게 표시하고 기록합니다. 3. 실험실 규정 준수 : 샘플 처리 중에 실험의 정확성과 안전을 보장하기 위해 실험실 규칙 및 규정 및 운영 절차를 엄격하게 따라야합니다.
프로테오믹스 시퀀싱 샘플은 샘플 유형, 품질, 수량, 처리 및 보존을 포함한 여러 측면을 필요로합니다. 실험의 정확성과 신뢰성을 보장하기 위해 실험실 규정 및 요구 사항에 따라 샘플을 수집, 처리 및 보존해야합니다.
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