DNA 标记技术 - Opentrons中国官网

DNA 마커

적응 형 서열을 갖는 DNA 및 라벨을 동시에 분류하는 기술은 주로 차세대 시퀀싱 (NGS)을위한 DNA 라이브러리를 효율적으로 준비하는 데 사용됩니다. 이 과정은 DNA 시퀀싱, 표적 연구, 메타고 유전학 및 염색질 분석 (예 : ATAC-Seq)과 같은 워크 플로에 중요합니다.

DNA 마킹이 필요한 워크 플로우는 무엇입니까?

DNA 마커의 주요 목적은 차세대 시퀀싱을 위해 DNA 라이브러리를 빠르고 효율적으로 준비하는 것입니다. 이 프로세스는 라이브러리 준비를 단순화하고 필요한 시간과 단계를 줄이며 시퀀싱 프로세스 중에 더 많은 균일 한 커버리지를 가능하게합니다. DNA 마커는 일반적으로 다음과 같은 다양한 워크 플로에서 사용됩니다.

DNA 시퀀싱, 특히 NGS 워크 플로.
특정 게놈 영역에 대한 관심에 대한 지시 된 시퀀싱 연구.
Metagenomic은 다른 생물학적 공동체를 서열하는 연구.
ATAC-Seq와 같은 염색질 분석 연구 (시퀀싱을 이용한 트랜스 포 사제-접촉성 염색질 분석).

DNA를 표시하는 가장 좋은 방법

NEXTERA DNA 라이브러리 준비 :이 상업적 방법은 Illumina에 의해 개발되었으며 특정 트랜스 포지를 사용하여 라벨을 붙였습니다.

ATAC-SEQ :이 방법은 마커와 시퀀싱을 결합하여 염색질의 접근성을 평가합니다.

맞춤형 트랜스 포 사제 시스템 : 일부 연구 팀은 특정 응용 또는 유기체를위한 트랜스 포 사제 효소 및 프로토콜을 최적화했습니다.

프로토콜 하이라이트

Opentrons는 OT-2 및 Opentrons Flex의 오픈 소스 프로토콜을 사용하여 DNA 표시를 자동화하는 데 도움이됩니다.

DNA 라벨링이 왜 그렇게 어려운가?

효소 민감도 : 트랜스 포 타제는 농도, 반응 시간 및 온도와 같은 다양한 요인에 민감합니다. 모든 작은 편차는 과잉 마킹 또는 언더 마킹으로 이어질 수 있습니다.

최적화 : 시퀀싱 중 균일 한 조각화 및 균일 커버리지를 달성하려면 마킹 조건의 신중한 최적화가 필요합니다.

DNA 품질 : DNA 샘플의 순도와 무결성은 라벨의 효율과 결과에 영향을 줄 수 있습니다.

수동 파이프 라인을 사용한 DNA 라벨링의 주요 과제

반복성 : 수동 피펫 팅은 효소 및 DNA 농도의 변화를 유발하여 일관성이없는 결과를 초래할 수 있습니다.

오염 위험 : 수동 피펫 팅은 샘플 간의 교차 오염 위험을 증가시킵니다.

효율성 : 여러 샘플을 동시에 준비하는 데는 많은 노동과 시간이 걸립니다.

수동 피펫 팅과 비교하여 자동 DNA 마커의 장점 :

일관성 및 반복성 : 자동화 시스템은 인간 오류를 줄이기 위해 일관된 수율을 제공합니다.

처리량 : 자동화 된 시스템은 여러 샘플을 동시에 처리하여 준비 시간을 크게 단축 할 수 있습니다.

오염 위험 감소 : 수동 개입을 줄이고 교차 오염 위험을 줄입니다.

최적화 : 자동화 시스템은 태깅 조건을 최적화하기 위해 여러 조건을 동시에 테스트하도록 프로그래밍 할 수 있습니다.

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저희에게 연락하는 것을 환영하며 전문 응용 프로그램 과학자 팀은 자동화 된 실험 프로세스가 귀하의 요구에 적합한 지 확인하는 데 도움을 줄 것입니다. 실험 프로세스의 운영을 볼 필요가 있다면 온라인 데모를 예약하여 전문가 팀과 실험 요구에 대해 논의 할 수 있습니다.

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