대사성 시퀀싱 샘플 및 샘플 크기 요구 사항

광대 한 생명 과학 연구 분야에서 대사체는 점차 신흥 및 역동적 인 징계로 등장하고 있습니다. 유기체의 대사 산물에 대한 포괄적 인 분석을 통해, 그것은 다른 생리 학적 상태, 질병 과정 및 환경 적 요인의 작용 하에서 유기체의 대사 변화를 보여준다. 그러나, 이러한 대사 변화를 정확하게 포착하기 위해, 대사 시퀀싱에 대한 샘플 및 샘플 크기 요구 사항이 특히 중요하다.

대사체 시퀀싱 샘플

1. 샘플 유형 대사체 연구는 다양한 샘플을 가지고 있습니다. 일반적인 것들이 포함됩니다. 1. 동물 또는 임상 샘플 : 혈청, 혈장, 소변, 타액, 뇌척수액, 관절액, 림프액, 조직 (예 : 간, 신장, 종양, 세포 및 배양 배지 등) 등. 2. 식물 샘플 : 잎, 줄기, 꽃, 뿌리, 과일 등과 같은 등. 3. 미생물 샘플 : 예를 들어 박테리아, 곰팡이 및 발효 국물 등과 같은.

2. 샘플 수집 및 보존은 수집 및 보존 할 때 다음과 같은 지점에주의를 기울여야합니다. 1. 혈액 샘플 (혈청, 혈장) : 적절한 정맥에서 혈액을 수집하십시오. 리튬 헤파린 항 응고 튜브 (혈장) 또는 일반 혈청 튜브를 사용하여 수집하십시오. 혈청 또는 혈장은 원심 분리에 의해 분리되고 분취 량 (예 : 0.5 mL 또는 0.1 mL)의 동결 저장 튜브로 옮깁니다. -80 -냉장고에 보관하고 배송시 충분한 드라이 아이스를 사용하십시오. 2. 소변 샘플 : 아침 (임상) 또는 아침에 1 시간의 소변 (동물)을 수집하십시오. 원심 분리 튜브로 직접 분취 량, 튜브 당 약 1ml. 가능한 빨리 아 지드 나트륨을 방부제로 첨가하십시오. -80 -냉장고에 보관하고 배송시 충분한 드라이 아이스를 사용하십시오. 3. 조직 샘플 : 동물이나 인간으로부터 조직을 제거한 후 정상 식염수로 헹구십시오. 깨끗한 먼지가없는 흡수성 종이를 사용하여 수분을 흡수 한 다음 마킹 된 원심 분리기 (예 : 20mg/튜브)의 원심 분리 튜브에 채 웁니다. 액체 질소에 빠르게 넣고 15 분 이상 얼린 다음 -80 ° C 냉장고에 보관하십시오. 4. 세포 샘플 : 현탁 된 세포의 경우 배양 배지와 함께 원심 분리 튜브로 옮기고 저속으로 원심 분리하여 세포를 펠릿합니다. 배양 배지를 쏟은 후 PBS로 한 번 씻어 다시 원심 분리 한 다음 PBS를 붓습니다. 원심 분리 튜브의 팁을 액체 질소에 삽입하여 세포를 켄 칭한 다음 -80 ° C 냉장고에 저장 하였다. 부착 된 세포의 경우 먼저 배지를 붓고 PBS로 한 번 씻은 다음 액체 질소로 배양 접시의 바닥에 닿아 세포를 해소하십시오. 메탄올 -아크 용액을 첨가하여 세포를 긁어 내고 원심 분리 튜브로 옮기고 -80 ℃의 냉장고에 보관한다. 5. 식물 샘플 : 전체 잎, 줄기, 꽃 또는 뿌리를 가져 와서 PBS로 신속하게 헹구어 토양 불순물 등을 제거하십시오. 원심 분리 튜브 또는 주석 호일에 넣고 그것을 표시하고 적어도 15 분 동안 동결 처리를 위해 액체 질소에 빠르게 넣으십시오. 제거 후 빠르게 자체 밀봉 백에 넣고 샘플 정보를 나타냅니다. -80 -냉장고에 보관하고 배송시 충분한 드라이 아이스를 사용하십시오. 6. 미생물 샘플 : 미생물 및 배양 배지를 원심 분리 튜브로 옮기고 저속으로 원심 분리하여 박테리아를 침전시킵니다. 배양 배지를 쏟은 후 PBS로 한 번 씻어 박테리아를 원심 분리하여 박테리아를 수집하십시오. 원심 분리 튜브 끝을 액체 질소에 삽입하여 박테리아를 켄 칭하여 -80 ° C 냉장고에 보관하십시오.

3. 샘플 크기 요구 사항. 대사 시퀀싱에 대한 샘플 크기 요구 사항은 일반적으로 실험 설계 및 샘플 유형에 따라 결정됩니다. 일반적으로 말하기 : 1. 혈액 샘플 : 최소 2ml가 필요합니다. 2. 소변 샘플 : 권장량은 5 ml 이상입니다. 3. 조직 샘플 : 조직의 유형 및 실험 요구에 따라 일반적으로 50mg 이상. 4. 세포 샘플 : 포유 동물 세포주의 경우, 1 × 10^7 세포/샘플이 일반적으로 필요합니다. 5. 식물 및 미생물 샘플 : 샘플 크기는 특정 실험 요구에 따라 다르지만, 검출의 정확성과 반복을 보장하기 위해 일반적으로 특정 숫자에 도달해야합니다. 너무 작은 표본 크기는 탐지의 정확도와 반복에 어느 정도 영향을 줄 수 있습니다. 따라서, 샘플을 수집 할 때는 반복적 인 동결 시동을 피하기 위해 가능한 한 많이 수집하고 얼리십시오. 동시에, 운송 중 샘플의 안정성을 보장하기 위해 샘플을 보낼 때 충분한 양의 드라이 아이스를 사용해야합니다.

대사 시퀀싱의 성공은 주로 샘플 선택 및 샘플 크기 설계에 달려 있습니다. 합리적인 샘플 선택은 데이터의 대표성을 보장 할 수 있지만, 적절한 샘플 크기는 실험의 통계적 효능을 향상시키고 연구자들이 전이 적 차이를 더 잘 발견 할 수 있도록 도와줍니다.

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