第2世代のシーケンスと第3世代シーケンスの違い

第二世代のシーケンスと第3世代のシーケンスは、現在のゲノム研究における2つの一般的なシーケンス技術であり、原則、パフォーマンス、およびアプリケーションに大きな違いがあります。ゲノム研究の継続的な深化により、第2世代のシーケンスと第3世代のシーケンスの使用シナリオはますます広範になり、それぞれに独自の利点と短所があります。

第2世代シーケンスと第3世代シーケンスの違い

第1世代および第2世代のシーケンスの概要第2世代シーケンス（ハイスループットシーケンスまたは次世代シーケンスとも呼ばれる）は、現在最も広く使用されているゲノムシーケンステクノロジーです。化学反応ベースの技術を使用して、DNAを断片化し、並列シーケンスを介して大規模なクローンに増幅することにより、大規模なゲノムデータ収集を完了します。 1.第2世代のシーケンスの利点は次のとおりです。（1）高スループット：数百万または数十億のDNAフラグメントを同時にシーケンスすることができますが、これは非常に効率的です。 （2）低コスト：比較的成熟した技術により、市場での第2世代のシーケンスプラットフォームのコストが大幅に削減され、ほとんどの科学研究機関と臨床研究所の最初の選択肢となっています。 （3）高精度：第2世代のシーケンスは、特に短い読み取り範囲内で高精度があり、より正確なゲノムデータを取得できるようにします。 2。第2世代のシーケンスの欠点は次のとおりです。（1）短い読み取り長：第2世代シーケンスの読み取りセグメントの長さは一般に短く（通常は100〜300bp）、一部の複雑な領域（反復シーケンス、構造変動など）の分析に制限があります。 （2）リピートシーケンスの分析の難しさ：シーケンスフラグメントが短いため、第2世代のシーケンスは長距離ゲノム構造に対処することが困難であり、複雑なゲノム構造と大規模な反復領域を効果的に再構築することは不可能です。

第2世代と第3世代のシーケンスの概要第2世代シーケンスとは異なり、第3世代シーケンステクノロジーは単一分子の直接シーケンスの方法であり、DNAを断片化する必要はありません。 。第3世代のシーケンスの最大の特徴は、「長い読み取りと長いシーケンス」と呼ばれる最大数千または数万の塩基対のDNAフラグメントを読み取ることができることです。 1.第3世代のシーケンスの利点には、次のものが含まれます。（1）長い読み取り長：第3世代のシーケンスは、より長い読み取り長（数千から数万のベースに到達できます）を提供し、複雑なゲノム構造、繰り返しのシーケンス、およびその他の困難をよりよく処理できるようにします。 （2）断片化は必要ありません：第3世代シーケンスは、単一のDNA分子を直接シーケンスして、第2世代シーケンスにおける断片化と増幅のプロセスを回避できる単一分子リアルタイムシーケンステクノロジーを使用します。 （3）構造的変動分析を実現できます。長い読み取りと長い特性により、第3世代のシーケンスは、遺伝子再編成、挿入、削除など、ゲノムの構造的変動をより正確に識別するのに役立ちます。 2。第3世代のシーケンスの欠点には次のものが含まれます。（1）高コスト：現在、第3世代のシーケンスのテクノロジーと機器は比較的新しいものであり、コストが高く、シーケンスデータの出力は比較的限られています。 （2）精度の問題：第3世代のシーケンスは、シーケンスの原則が異なるため、長い読み取りデータを取得できますが、単一シーケンスのエラー率は高いため、第2世代のシーケンスデータを組み合わせることで精度を改善する必要があります。

3つのシーケンスと第3世代のシーケンスの主な違い 1。第3世代シーケンスは、単一分子リアルタイムシーケンステクノロジーを使用して、断片化のない単一のDNA分子のシーケンスを直接決定します。 2。読み取り長：第2世代のシーケンスの読み取り長は短く、通常は100〜300bpの間で、第3世代のシーケンスの読み取り長は数千から数万の塩基に達する可能性があります。長い読み取り長により、3世代のシーケンスは、ゲノムアセンブリと複雑な領域分析において明らかな利点があります。 3.精度：第2世代のシーケンスは、特に短い読み取りの場合、長いゲノムシーケンスを正確に取得できます。ただし、その断片化特性により、シーケンスを繰り返すなどの複雑な領域に対処することは困難です。第3世代のシーケンスは長い読み取りの利点を提供できますが、その単一のシーケンスはエラー率が高く、通常、他のデータと組み合わせて修正が必要です。 4。アプリケーションシナリオ：第2世代シーケンスは通常、ゲノムシーケンス、トランスクリプトーム分析、小規模ゲノム分析などに使用され、大規模なデータ生成が必要であり、読み取り長が必要なシナリオに適しています。第3世代のシーケンスは、構造変異分析、ゲノムアセンブリ、複雑なゲノムに関する研究でより使用されており、特に長い読みが必要な研究ニーズに適しています。

第二世代のシーケンスと第3世代のシーケンスはそれぞれ、ゲノム研究における独自の利点と欠点を持っています。第二世代のシーケンスは、スループットが高く、低コストと高精度を備えたほとんどの従来のゲノム研究に適しています。長い読み取りと長い特性により、第3世代のシーケンスは、複雑なゲノム構造、繰り返しシーケンス、構造変動分析を扱う上で比類のない利点を持っています。研究のニーズによれば、適切なシーケンス技術を選択することで、ゲノミクスの研究プロセスをより効率的に促進できます。

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