メタボロームシーケンスサンプルとサンプルサイズの要件

生命科学研究の広大な分野では、メタボロミクスは徐々に新たな動的な規律として浮上しています。生物中の代謝産物の包括的な分析を通じて、さまざまな生理学的状態、疾患コース、環境要因の作用下で生物の代謝変化を明らかにします。ただし、これらの代謝変化を正確にキャプチャするために、メタボロミックシーケンスのサンプルおよびサンプルサイズの要件が特に重要です。

メタボロミクスシーケンスサンプル

1.サンプル型メタボロミクス研究にはさまざまなサンプルがあり、一般的なものには次のものが含まれます。1。血清、血漿、尿、唾液、脳脊髄液、関節液、リンパ液、組織（肝臓、腎臓、筋肉、腫瘍など）、およびその培地など。 2。植物サンプル：葉、茎、花、根、果物などなど。 3。微生物サンプル：細菌、菌類、その発酵スープなど。

2。サンプルの収集と保存。さまざまな種類のサンプルは、収集および保存する際に次のポイントに注意を払う必要があります。1。血液サンプル（血清、血漿）：通常、収集量は約10mlです。リチウムヘパリン抗凝固チューブ（血漿用）または通常の血清チューブを使用して収集します。血清または血漿は、遠心分離により分離され、アリコート（0.5 mLまたは0.1 mLなど）の凍結貯蔵チューブに移します。 -80の冷蔵庫に保管し、輸送するときに十分なドライアイスを使用します。 2。尿サンプル：朝（臨床）または朝の1時間の尿（動物）から中央部の尿を収集します。チューブあたり約1 mLの遠心チューブに直接アリコートします。アジドナトリウムを防腐剤として加え、できるだけ早く遠心分離機として加えます。 -80の冷蔵庫に保管し、輸送するときに十分なドライアイスを使用します。 3。組織サンプル：動物または人間から組織を除去した後、通常の生理食塩水ですすぎます。きれいなほこりのない吸収剤を使用して、水分を吸収し、マークされた遠心チューブに等しい部分（20mg/チューブなど）に入れます。液体窒素にすばやく入れて、少なくとも15分間凍結し、-80°C冷蔵庫に保管します。 4。細胞サンプル：懸濁した細胞の場合、培地と一緒に遠心チューブに移し、低速で遠心分離することにより細胞をペレットします。培地を注ぎ出した後、PBSで一度洗って、再び遠心分離してから、PBSを注ぎます。遠心チューブの先端を液体窒素に挿入して細胞を消光し、-80°C冷蔵庫に保存しました。接着細胞の場合、最初に培地を注ぎ、PBSで一度洗浄し、液体窒素で培養皿の底に接触して細胞を消します。メタノール水溶液を加えて細胞を削り、遠心管に移し、-80°Cの冷蔵庫に保管します。 5。植物のサンプル：葉全体、茎、花または根を取り、土壌不純物を除去するためにPBSですばやくすすいでください。遠心チューブまたはスズ箔に入れてマークを付け、液体窒素にすばやく入れて、少なくとも15分間凍結治療を行います。取り外し後、自己封印バッグにすばやく入れて、サンプル情報を示します。 -80の冷蔵庫に保管し、輸送するときに十分なドライアイスを使用します。 6.微生物サンプル：微生物と培養培地を遠心管に移し、細菌を沈殿させるために低速で遠心分離します。培地を注いだ後、PBSで一度洗浄し、細菌を遠心にして細菌を集めます。遠心チューブの先端を液体窒素に挿入して、細菌を消し、-80°C冷蔵庫に保管します。

3。サンプルサイズの要件。一般的に言えば：1。血液サンプル：少なくとも2 mLが必要です。 2。尿サンプル：推奨量は5 mL以上です。 3.組織サンプル：組織の種類と実験的ニーズに応じて、一般的に50 mg以上。 4。細胞サンプル：哺乳類の細胞株の場合、1×10^7細胞/サンプルが通常必要です。 5。植物と微生物のサンプル：サンプルサイズは特定の実験的ニーズに依存しますが、通常、検出の精度と繰り返しを確保するために特定の数に到達する必要があります。サンプルサイズが小さすぎると、検出の精度と繰り返しにある程度影響を与える可能性があります。したがって、サンプルを収集するときは、繰り返しの凍結融解を避けるために、サンプルを可能な限り収集して凍結してみてください。同時に、輸送中にサンプルの安定性を確保するためにサンプルを送信するときに、十分な量のドライアイスを使用する必要があります。

メタボロミックシーケンスの成功は、サンプル選択とサンプルサイズの設計に大きく依存します。合理的なサンプル選択はデータの代表性を確保することができますが、適切なサンプルサイズは実験の統計的有効性を改善し、研究者が転移性の違いをよりよく発見するのに役立ちます。

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