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DNAプライマーは、ヌクレオチド重合の開始時に合成を刺激する特定のヌクレオチド配列を持つ高分子です。簡単に言えば、DNAプライマーは、通常10〜30のヌクレオチドで構成される短い一本鎖核酸断片であり、DNA複製または増幅のプロセスで「ガイド」の役割を果たします。
1。定義と分類1。定義:DNAプライマーは、DNAテンプレート鎖を補完し、DNAポリメラーゼの出発点を提供するオリゴヌクレオチド配列を指し、それにより新しいDNA鎖を合成するように導きます。 2。分類:異なるソースによると、DNAプライマーは自然に発生するRNAプライマーと人為的に合成されたDNAプライマーに分割できます。 DNA複製中、自然に発生するプライマーのほとんどは、PRIASEによって合成されるRNAプライマーです。
2。機能と特性1。機能:DNAプライマーの主な機能は、ヌクレオチド重合の出発点として機能し、DNAポリメラーゼにプライマーの3 '末端から新しいDNA鎖を合成するように導くことです。 DNA複製中、RNAプライマーは最初にDNAテンプレート鎖に結合し、次にDNAポリメラーゼがプライマーの3 '端から伸びて、新しいDNA鎖を合成します。 PCRなどのin vitro増幅技術では、人為的に合成されたDNAプライマーが同じ役割を果たします。 2。特性:(1)相補性:DNAプライマーのベース配列は、DNAポリメラーゼを効果的に結合および誘導するために、ターゲットテンプレートストランドを完全に相補的でなければなりません。 (2)長さ:DNAプライマーの長さは通常、18〜30の塩基です。短すぎるプライマーは、特異性の低下につながる可能性がありますが、長すぎるプライマーは増幅効率に影響を与える可能性があります。 (3)GC含有量:DNAプライマーのGC含有量は、最良の増幅効率を得るためにテンプレートストランドのGC含有量と類似する必要があります。 GC含有量が過度に高または低い場合は、プライマーの結合と増幅反応の進行を助長しません。 (4)融解温度(TM値):DNAプライマーの融解温度は、増幅反応のアニーリング温度よりも高くする必要があり、プライマーがテンプレート鎖に効果的に結合できるようにします。 TM値は、式またはソフトウェアによって計算および予測できます。
3。設計とアプリケーション1。設計原則:(1)密接な相補性:プライマーとテンプレートチェーンのシーケンスは、プライマーがテンプレートチェーンに正確にバインドできるように、密接に相補的でなければなりません。 (2)二量体とヘアピンの構造を避ける:プライマーの結合と増幅効率に影響を与えることを避けるために、プライマー間で安定したダイマーまたはヘアピン構造を避ける必要があります。 (3)不一致を避ける:プライマーは、テンプレート鎖の非ターゲット部位でDNA重合をトリガーすることはできません。つまり、不一致を避けます。 (4)プライマーの長さ、製品の長さ、シーケンスTM値、プライマーとテンプレート間の二重鎖の形成の内部安定性など、他の要因を考慮してください。 2。アプリケーション:DNAプライマーは、DNA増幅(PCR、QPCR、RT-PCRなど)、DNAシーケンス(サンガーシーケンス、第2世代シーケンスなど)、遺伝子発現分析(QPCR、RNA-SEQなどなど)を含む分子生物学研究で幅広い応用値を持っています。異なる長さとシーケンスのプライマーを設計することにより、異なるサイズとシーケンスのDNAフラグメントの増幅とシーケンスを達成できます。
4。注1。DNAプライマーを設計する場合、ターゲットテンプレートのシーケンス特性と増幅ニーズを完全に考慮し、適切なプライマー長、GC含有量、TM値を選択する必要があります。 2。プライマー設計が完了した後、プライマーの特異性と増幅効率を確保するために、爆風検出などのバイオインフォマティクス分析を実行する必要があります。 3. DNA増幅やシーケンスなどの実験を実施する場合、実験結果の精度と信頼性を確保するために、実験的な手順と操作仕様に厳密に従う必要があります。
DNAプライマーは、現代の分子生物学研究で不可欠な役割を果たします。基礎研究であろうと臨床診断であろうと、DNAプライマーの関連知識を習得することは、科学的研究者や技術者にとって非常に重要です。合理的なプライマーの設計と使用を通じて、私たちは遺伝的研究の進歩を効果的に促進し、人生の謎をより深く理解するのに役立ちます。
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