微分タンパク質スクリーニングにおける完全に自動ピペッティングワークステーションのワークフロー

生命科学研究の広大な分野では、生命の謎を明らかにするための重要なツールとしてのプロテオミクスは、科学研究者から広範囲にわたる注目を集めています。プロテオミクスは、生物のすべてのタンパク質の構造と機能を包括的に分析することを目的としており、微分タンパク質スクリーニングは重要な研究内容の1つです。さまざまな生理学的または病理学的条件下で大幅に変化するタンパク質を特定し、生物学的プロセス、疾患発達、薬物反応におけるこれらのタンパク質の重要な役割を明らかにするのに役立ちます。

フルオートマチックピペッティングワークステーション

1。サンプル調製1。サンプル収集：研究目的とサンプル源（組織サンプル、血清または細胞培養上清など）に従って、さまざまな条件または組織からタンパク質サンプルを収集します。 2。タンパク質抽出：サンプルの複雑さと高品質のタンパク質を抽出するタンパク質の存在量の範囲を考慮して、適切なタンパク質抽出法を選択します。 3。定量化と前処理：抽出されたタンパク質サンプルを定量化して、実験で同じ量のタンパク質が使用されるようにします。次に、低積層タンパク質の除去、特定の種類のタンパク質などを濃縮するなど、微分タンパク質の検出感度を改善するなど、前処理ステップが実行されます。

2。タンパク質分離1。選択分離技術：ゲル電気泳動（SDS-PAGE、2次元ゲル電気泳動2-DEなど）や液体クロマトグラフィ（HPLC、イオン交換クロマトグラフィー、リバースフェーズクロマトグラフィーなど）などの分離技術を使用して、タンパク質を異なるバンドまたはパークに分離します。 2。完全自動ピペッティングワークステーションの操作：（1）ピペッティングプログラムの設定：実験要件に従って、ピペッティングボリューム、ピペッティング速度、ピペッティング時間の数などのパラメーターを含む、完全に自動ピペッティングワークステーションのピペッティングプログラムを設定します。 （2）自動ピペッティングと分離：完全に自動ピペッティングワークステーションは、各実験の精度と一貫性を確保するために、設定手順に従ってピペッティングと分離操作を自動的に完了します。

3。質量分析分析1。質量分析技術の選択：質量分析技術（タンデム質量分析MS/MS、LC-MS/MSと組み合わせた液体クロマトグラフィー質量分析など）を使用して、分離タンパク質を識別および定量化します。 2。サンプル処理と注射：孤立したタンパク質サンプルは、酵素溶解、誘導体化などなど、適切に処理され、注射のために質量分析計にロードされます。完全に自動ピペッティングワークステーションは、このステップを自動的に完了して、サンプル処理の精度と一貫性を確保できます。 3。質量分析データの収集：質量分析計は、注入されたタンパク質サンプルをスキャンして分析して、質量分析データを収集します。

4。データ分析1。質量分析データ分析：データベース検索、ライブラリマッチング、定量的ソフトウェアの助けを借りて、質量分析データを分析および識別して特定したタンパク質を決定します。 2。微分タンパク質スクリーニング：（1）データ前処理：データ分析の精度を改善するための、除去、正規化などの質量分析データの前処理。 （2）統計分析：統計的方法（t検定、分散分析、部分最小二乗回帰など）を使用して、異なる条件間のタンパク質発現レベルを比較し、微分タンパク質を識別します。完全に自動的なピペッティングワークステーションによって提供される高精度および一貫性データは、統計分析の精度を改善するのに役立ちます。 （3）複数の仮説検査補正：微分タンパク質スクリーニングを実行する場合、誤陽性の結果を減らすために、BH FDR補正法などの複数の仮説検査補正が通常必要です。 3。機能的注釈と濃縮分析：生物学的プロセスと関連する代謝経路におけるその役割を理解するための微分タンパク質の機能的注釈。同時に、微分タンパク質の経路濃縮分析や微分タンパク質相互作用ネットワークの構築などのバイオインフォマティック分析を実施して、生物学的プロセスにおけるこれらの微分タンパク質の役割をさらに理解しました。

5。結果の検証と追跡調査1.差異タンパク質の検証：他の実験方法（ウエスタンブロット、免疫蛍光など）を使用して、スクリーニングされた微分タンパク質の発現レベルと機能を検証します。 2。追跡調査：フォローアップ研究は、疾患の発生と発達における役割の調査、潜在的な薬物標的の発見など、スクリーニングされた微分タンパク質に基づいて行われます。

完全に自動ピペッティングワークステーションの助けを借りて、微分タンパク質スクリーニング実験は、より速く、より正確で、より信頼性が高まっています。研究者は、さまざまな生理学的または病理学的状態で大幅に変化するタンパク質を迅速に特定し、生物学的プロセス、疾患の発生、薬物反応におけるこれらのタンパク質の重要な役割を詳細に調査することができます。これは、疾患の診断と治療のための新しいアイデアと方法を提供するだけでなく、新薬の研究開発とバイオマーカーの発見の分野の新しい方法を開きます。

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