DNA 标记技术 - Opentrons中国官网

DNAマーカー

DNAと適応シーケンスのラベルを同時にセグメント化する手法は、主に次世代シーケンス（NGS）のDNAライブラリを効率的に準備するために使用されます。このプロセスは、DNAシーケンス、標的研究、メタゲノミクス、クロマチン分析（ATAC-seqなど）などのワークフローにとって重要です。

DNAマーキングが必要なワークフローは何ですか？

DNAマーカーの主な目的は、次世代シーケンスのためにDNAライブラリーを迅速かつ効率的に準備することです。このプロセスは、ライブラリの準備を簡素化し、必要な時間と手順を短縮し、シーケンスプロセス中により均一なカバレッジを可能にします。 DNAマーカーは、次のようなさまざまなワークフローで一般的に使用されます。

DNAシーケンス、特にNGSワークフロー。
特定のゲノム領域への関心に関する指示されたシーケンス研究。
さまざまな生物学的コミュニティを配列するメタゲノム研究。
ATAC-seqなどのクロマチン分析研究（シーケンスを使用したトランスポサゼ接続性クロマチンの分析）。

DNAにラベルを付ける最良の方法

Nextera DNAライブラリーの準備：この市販の方法はイルミナによって開発され、特定のトランスポサゼを使用してラベル付けされました。

ATAC-SEQ：この方法では、マーカーとシーケンスを組み合わせて、クロマチンのアクセシビリティを評価します。

カスタマイズされたトランスポサゼシステム：一部の研究チームは、特定の用途または生物のためにトランスポサゼ酵素とプロトコルを最適化しています。

プロトコルのハイライト

Opentronsは、OT-2とOpentrons Flexのオープンソースプロトコルを使用してDNAマーキングの自動化を支援します

なぜDNAの標識がそんなに難しいのですか？

酵素感受性：トランスポサゼは、濃度、反応時間、温度などのさまざまな要因に敏感です。すべての小さな逸脱は、オーバーマークまたはアンダーマークにつながる可能性があります。

最適化：シーケンス中に均一な断片化と均一なカバレッジを実現するには、マーキング条件の慎重な最適化が必要です。

DNAの品質：DNAサンプルの純度と完全性は、ラベルの効率と結果に影響を与える可能性があります。

手動パイプラインによるDNA標識の重要な課題

再現性：手動のピペッティングは、酵素とDNA濃度の変化を引き起こす可能性があり、結果として一貫性のない結果が生じます。

汚染のリスク：手動のピペッティングは、サンプル間の相互汚染のリスクを高めます。

効率：複数のサンプルを同時に準備するには、多くの労力と時間がかかります。

手動のピペッティングと比較した自動DNAマーカーの利点：

一貫性と再現性：自動化されたシステムは、人的エラーを減らすために一貫した収量を提供します。

スループット：自動化されたシステムは、複数のサンプルを同時に処理でき、準備時間を大幅に短縮できます。

汚染リスクを減らす：手動介入を減らし、相互汚染リスクを減らします。

最適化：自動化システムをプログラムして、複数の条件を同時にテストして、タグ付け条件を最適化するのに役立ちます。

詳細をご覧ください

お問い合わせください。お問い合わせください。プロのアプリケーション科学者チームは、自動化された実験プロセスがお客様のニーズに適していることを確認するお手伝いをします。実験プロセスの操作を表示する必要がある場合は、オンラインデモを予約して、実験的なニーズを専門家チームと深く話し合うことができます。

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